seq1 = pF1KE5314.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KE5314/gi568815588r_17490367.tfa (gi568815588r:17490367_17717339), 226973 bp

>pF1KE5314 864
>gi568815588r:17490367_17717339 (Chr10)

(complement)

1-257  (100001-100257)   99% ->
258-375  (113293-113410)   100% ->
376-394  (113596-113614)   100% ->
395-483  (113692-113780)   100% ->
484-605  (117929-118050)   100% ->
606-784  (122957-123135)   100% ->
785-864  (126894-126973)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCGCCTGACGGAAGCGGCGGCAGCGGGCAGCGGCTCTCGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCGCCTGACGGAAGCGGCGGCAGCGGGCAGCGGCTCTCGGGCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGCTGGGCAGGGTCCCCTCCCACGCTCCTGCCGCTGTCTCCCACGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGCTGGGCAGGGTCCCCTCCCACGCTCCTGCCGCTGTCTCCCACGTCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAGGTGCGCGGCCACCATGGCGTCCAGCGACGAGGACGGCACCAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAGGTGCGCGGCCACCATGGCGTCCAGCGACGAGGACGGCACCAACGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGCCTCGGAGGCCGGCGAGGACCGGGAGGCTCCCGGCAAGCGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100151 GGCGCCTCGGAGGCCGGCGAGGACCGGGAGGCTCCCGGCGAGCGGAGGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGGGTTCTTGGCCACCGCCTGGCTCACCTTCTACGACATCGCCATGA
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGGGGTCTTGGCCACCGCCTGGCTCACCTTCTACGACATCGCCATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGCGGG         GTGGTTGGTTCTAGCTATTGCCATGGTACGTTTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGCGGGGTA...TAGGTGGTTGGTTCTAGCTATTGCCATGGTACGTTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TATATGGAAAAAGGAACACACAGAGGTTTATATAAAAGTATTCAGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113327 TATATGGAAAAAGGAACACACAGAGGTTTATATAAAAGTATTCAGAAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ACTTAAATTTTTCCAGACATTTGCCTTGCTTGAG         ATAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 113377 ACTTAAATTTTTCCAGACATTTGCCTTGCTTGAGGTA...CAGATAGTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTGTTTAATTG         GAATTGTACCTACTTCTGTGATTGTGACT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 113603 ACTGTTTAATTGGTG...AAGGAATTGTACCTACTTCTGTGATTGTGACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGGTCCAAGTGAGTTCAAGAATCTTTATGGTGTGGCTCATTACTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113721 GGGGTCCAAGTGAGTTCAAGAATCTTTATGGTGTGGCTCATTACTCACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TATAAAACCA         ATCCAGAATGAAGAGAGTGTGGTGCTTTTTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 113771 TATAAAACCAGTA...CAGATCCAGAATGAAGAGAGTGTGGTGCTTTTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGTCGCGTGGACTGTGACAGAGATCACTCGCTATTCCTTCTACACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117960 TGGTCGCGTGGACTGTGACAGAGATCACTCGCTATTCCTTCTACACATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AGCCTTCTTGACCACTTGCCATACTTCATTAAATGGGCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 118010 AGCCTTCTTGACCACTTGCCATACTTCATTAAATGGGCCAGGTG...CAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATATAATTTTTTTATCATCTTATATCCTGTTGGAGTTGCTGGTGAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122957 ATATAATTTTTTTATCATCTTATATCCTGTTGGAGTTGCTGGTGAACTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTACAATATACGCTGCCTTGCCGCATGTGAAGAAAACAGGAATGTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123007 TTACAATATACGCTGCCTTGCCGCATGTGAAGAAAACAGGAATGTTTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ATAAGACTTCCTAACAAATACAATGTCTCTTTTGACTACTATTATTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123057 ATAAGACTTCCTAACAAATACAATGTCTCTTTTGACTACTATTATTTTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TCTTATAACCATGGCATCATATATACCTT         TGTTTCCACAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 123107 TCTTATAACCATGGCATCATATATACCTTGTA...AAGTGTTTCCACAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCTATTTTCATATGTTACGTCAAAGAAGAAAGGTGCTTCATGGAGAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126906 TCTATTTTCATATGTTACGTCAAAGAAGAAAGGTGCTTCATGGAGAGGTG

    900     .    :    .
    847 ATTGTAGAAAAGGATGAT
        ||||||||||||||||||
 126956 ATTGTAGAAAAGGATGAT