seq1 = pF1KE5310.tfa, 924 bp
seq2 = pF1KE5310/gi568815595f_98369577.tfa (gi568815595f:98369577_98570500), 200924 bp

>pF1KE5310 924
>gi568815595f:98369577_98570500 (Chr3)

1-924  (100001-100924)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAAGAAAATCATACCATGAAAAATGAGTTTATCCTCACAGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAAGAAAATCATACCATGAAAAATGAGTTTATCCTCACAGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACAGATCACCCTGAGCTGAAGACTCTGCTGTTTGTGGTGTTCTTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACAGATCACCCTGAGCTGAAGACTCTGCTGTTTGTGGTGTTCTTTGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATCTGATCACCGTGGTGGGGAATATTAGTTTGGTGGCACTGATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATCTGATCACCGTGGTGGGGAATATTAGTTTGGTGGCACTGATATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACACACCGTCGGCTTCACACACCAATGTACATCTTTCTGGGAAATCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACACACCGTCGGCTTCACACACCAATGTACATCTTTCTGGGAAATCTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTTGTGGATTCTTGCTGTGCCTGTGCTATTACCCCCAAAATGTTAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTTGTGGATTCTTGCTGTGCCTGTGCTATTACCCCCAAAATGTTAGAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTCTTTTCTGAGAACAAAAGGATTTCCCTCTATGAATGTGCAGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTCTTTTCTGAGAACAAAAGGATTTCCCTCTATGAATGTGCAGTACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTATTTTCTTTGCACTGTGGAAACTGCAGACTGCTTTCTTCTGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTATTTTCTTTGCACTGTGGAAACTGCAGACTGCTTTCTTCTGGCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCCTATGACCGCTATGTGGCCATATGCAACCCACTGCAGTACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCCTATGACCGCTATGTGGCCATATGCAACCCACTGCAGTACCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATGATGTCCAAGAAACTCTGCATTCAGATGACCACAGGGGCCTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATGATGTCCAAGAAACTCTGCATTCAGATGACCACAGGGGCCTTCATA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGGAAACCTGCATTCCATGATTCATGTAGGGCTTGTATTTAGGTTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGGAAACCTGCATTCCATGATTCATGTAGGGCTTGTATTTAGGTTAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGTGGATCGAATCACATCAACCACTTTTACTGTGATATTCTTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGTGGATCGAATCACATCAACCACTTTTACTGTGATATTCTTCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGTATAGACTCTCTTGTGTTGATCCTTATATCAATGAACTGGTTCTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGTATAGACTCTCTTGTGTTGATCCTTATATCAATGAACTGGTTCTATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTTCTCAGGTTCAGTTCAAGTCTTTACCATAGGTAGTGTCTTAATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCTTCTCAGGTTCAGTTCAAGTCTTTACCATAGGTAGTGTCTTAATATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATCTCTATATTCTTCTTACTATTTTCAAAATGAAATCCAAAGAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATCTCTATATTCTTCTTACTATTTTCAAAATGAAATCCAAAGAGGGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGGCCAAAGCTTTTTCTACCTGTGCATCCCACTTTTTGTCAGTTTCATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGGCCAAAGCTTTTTCTACCTGTGCATCCCACTTTTTGTCAGTTTCATTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGATCTCTTTTCTTCATGTACGTTAGACCAAATTTGCTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGATCTCTTTTCTTCATGTACGTTAGACCAAATTTGCTTGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AGGGGATAAAGATATACCAGCTGCAATTTTATTTACAATAGTAGTTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AGGGGATAAAGATATACCAGCTGCAATTTTATTTACAATAGTAGTTCCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TACTAAATCCTTTCATTTATAGCCTGAGAAATAGGGAAGTAATAAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TACTAAATCCTTTCATTTATAGCCTGAGAAATAGGGAAGTAATAAGTGTC

    900     .    :    .    :
    901 TTAAGAAAAATTCTGATGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||
 100901 TTAAGAAAAATTCTGATGAAGAAA