seq1 = pF1KE5307.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KE5307/gi568815594r_1593600.tfa (gi568815594r:1593600_1812188), 218589 bp

>pF1KE5307 810
>gi568815594r:1593600_1812188 (Chr4)

(complement)

1-59  (100001-100059)   100% ->
60-176  (100199-100315)   100% ->
177-281  (108489-108593)   100% ->
282-341  (112119-112178)   100% ->
342-479  (112488-112625)   100% ->
480-629  (115838-115987)   100% ->
630-696  (117349-117415)   100% ->
697-810  (118476-118589)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGCCGCCCGCGAAGCCCGCCGAGGCATCAGAGCCGCTGCGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTGCCGCCCGCGAAGCCCGCCGAGGCATCAGAGCCGCTGCGACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGACGCCAG         CCCGCCGTCCCCCGCGCGATGGAGCCTGGGAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGACGCCAGGTG...CAGCCCGCCGTCCCCCGCGCGATGGAGCCTGGGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAAGCGCAGAGCCGACGGCAGGCGCTGGAGGCCCGAAGACGCCGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100231 GGAAGCGCAGAGCCGACGGCAGGCGCTGGAGGCCCGAAGACGCCGAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCAGAGCACCGCGGCGCCGAGCGCAGACCCGAGAG         CTTTAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100281 GCAGAGCACCGCGGCGCCGAGCGCAGACCCGAGAGGTG...CAGCTTTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CACTCCTGAAGGCCCTAAACCCCGTTCCAGATGCTCTGACTGGGCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108495 CACTCCTGAAGGCCCTAAACCCCGTTCCAGATGCTCTGACTGGGCAAGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGTTGAAGAAGATGAAATGAGGACCAGAGTTAACAAAGAAATGGCAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 108545 CAGTTGAAGAAGATGAAATGAGGACCAGAGTTAACAAAGAAATGGCAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282         ATATAAAAGGAAACTCCTCATCAATGACTTTGGAAGAGAGAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108595 TA...CAGATATAAAAGGAAACTCCTCATCAATGACTTTGGAAGAGAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAATCATCATCAGGAAG         TTCTGATTCAAAGGAGTCTATGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 112161 AAAATCATCATCAGGAAGGTA...CAGTTCTGATTCAAAGGAGTCTATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CTACTGTGCCGGCTGACTTTGAGACAGATGAAAGTGTCCTAATGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112511 CTACTGTGCCGGCTGACTTTGAGACAGATGAAAGTGTCCTAATGAGGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAGAAGCAGATCAACTATGGGAAGAACACAATTGCCTACGATCGTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112561 CAGAAGCAGATCAACTATGGGAAGAACACAATTGCCTACGATCGTTATAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAAAGAAGTCCCAAG         ACACCTTCGACAACCTGGCATTCATC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 112611 TAAAGAAGTCCCAAGGTA...TAGACACCTTCGACAACCTGGCATTCATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 CCAAGACCCCTAATAAATTTAAGAAGTATAGTCGACGTTCATGGGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115864 CCAAGACCCCTAATAAATTTAAGAAGTATAGTCGACGTTCATGGGACCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAAATCAAACTCTGGAAGGTGGCTCTGCATTTTTGGGATCCTCCAGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115914 CAAATCAAACTCTGGAAGGTGGCTCTGCATTTTTGGGATCCTCCAGCGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGAAGGATGTGATTTGCAAGAAAT         ACACCCTGTAGACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 115964 AGAAGGATGTGATTTGCAAGAAATGTA...CAGACACCCTGTAGACCTTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AATCTGCAGAAAGCAGCTCCGAGCCCCAGACCAGCTCTCAGGATGACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117366 AATCTGCAGAAAGCAGCTCCGAGCCCCAGACCAGCTCTCAGGATGACTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697          GATGTGTACTCTGGCACACCCACCAAGGTGAGACACATGGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117416 GTA...CAGGATGTGTACTCTGGCACACCCACCAAGGTGAGACACATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CAGTCAAGTGGAGGATGAGTTTGATTTGGAAGCTTGTTTAACTGAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118517 CAGTCAAGTGGAGGATGAGTTTGATTTGGAAGCTTGTTTAACTGAACCCT

    850     .    :    .    :
    788 TGAGAGACTTCTCAGCCATGAGC
        |||||||||||||||||||||||
 118567 TGAGAGACTTCTCAGCCATGAGC