seq1 = pF1KE5294.tfa, 663 bp
seq2 = pF1KE5294/gi568815596r_162210724.tfa (gi568815596r:162210724_162418307), 207584 bp

>pF1KE5294 663
>gi568815596r:162210724_162418307 (Chr2)

(complement)

1-453  (100001-100453)   100% ->
454-663  (107375-107584)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAATGGGTATTCCACAGACGAGAATTTCCGCTATCTCATCTCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAATGGGTATTCCACAGACGAGAATTTCCGCTATCTCATCTCGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCAGGGCCAGGGTGAAAATGTACATCCAGGTGGAGCCTGTGCTGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCAGGGCCAGGGTGAAAATGTACATCCAGGTGGAGCCTGTGCTGGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCTGACCTTTCTGCCTGCAGAGGTGAAGGAGCAGATTCAGAGGACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCTGACCTTTCTGCCTGCAGAGGTGAAGGAGCAGATTCAGAGGACAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCACCTCCGGGAACATGCAGGCAGTTGAACTGCTGCTGAGCACCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCACCTCCGGGAACATGCAGGCAGTTGAACTGCTGCTGAGCACCTTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGGGAGTCTGGCACCTTGGTTGGACTCGGGAATTCGTGGAGGCCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGGGAGTCTGGCACCTTGGTTGGACTCGGGAATTCGTGGAGGCCCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAGAACCGGCAGCCCTCTGGCCGCCCGCTACATGAACCCTGAGCTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAGAACCGGCAGCCCTCTGGCCGCCCGCTACATGAACCCTGAGCTCACG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACTTGCCCTCTCCATCGTTTGAGAACGCTCATGATGAATATCTCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACTTGCCCTCTCCATCGTTTGAGAACGCTCATGATGAATATCTCCAACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGAACCTCCTTCAGCCCACTCTGGTGGACAAGCTTCTAGTTAGAGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGAACCTCCTTCAGCCCACTCTGGTGGACAAGCTTCTAGTTAGAGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCTTGGATAAGTGCATGGAGGAGGAACTGTTGACAATTGAAGACAGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCTTGGATAAGTGCATGGAGGAGGAACTGTTGACAATTGAAGACAGAAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGG         ATTGCTGCTGCAGAAAACAATGGAAATGAATCAGGTGT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGGGTA...CAGATTGCTGCTGCAGAAAACAATGGAAATGAATCAGGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 AAGAGAGCTACTAAAAAGGATTGTGCAGAAAGAAAACTGGTTCTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107413 AAGAGAGCTACTAAAAAGGATTGTGCAGAAAGAAAACTGGTTCTCTGCAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTCTGAATGTTCTTCGTCAAACAGGAAACAATGAACTTGTCCAAGAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107463 TTCTGAATGTTCTTCGTCAAACAGGAAACAATGAACTTGTCCAAGAGTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ACAGGCTCTGATTGCTCAGAAAGCAATGCAGGTATTTGTAATTTTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107513 ACAGGCTCTGATTGCTCAGAAAGCAATGCAGGTATTTGTAATTTTACTGA

    650     .    :    .    :
    642 GGAAGATTCTTCAAATTCTGCC
        ||||||||||||||||||||||
 107563 GGAAGATTCTTCAAATTCTGCC