seq1 = pF1KE5291.tfa, 732 bp
seq2 = pF1KE5291/gi568815586r_98513588.tfa (gi568815586r:98513588_98714319), 200732 bp

>pF1KE5291 732
>gi568815586r:98513588_98714319 (Chr12)

(complement)

1-732  (100001-100732)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACAATTGAAGTCTTTTCAAATAATTGCTCATCTAAAGCGTCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAACAATTGAAGTCTTTTCAAATAATTGCTCATCTAAAGCGTCTACA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAAGAAATTAATGAGGTAAAAACTTGGTCCAATAGGATAACTGAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAAGAAATTAATGAGGTAAAAACTTGGTCCAATAGGATAACTGAAAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATATACTGAACAACAGTCTGACGACGCTTTCTCAAGACATTACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGATATACTGAACAACAGTCTGACGACGCTTTCTCAAGACATTACAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAGACCAAAGTACAACTTCCATGGCAAAAGATGTTGGTCTCAAGATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTAGACCAAAGTACAACTTCCATGGCAAAAGATGTTGGTCTCAAGATTAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAGTGTAAAAACAGATATACGACGGATTTCAGGTTTAGTAACTGATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAGTGTAAAAACAGATATACGACGGATTTCAGGTTTAGTAACTGATGTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATCATTGACAGATTCTGTGCAAGAACTAGAAAATAAAATAGAGAAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TATCATTGACAGATTCTGTGCAAGAACTAGAAAATAAAATAGAGAAAGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAAAAAATACAGTAAAAAATATAGGTGATCTTCTTTCAAGCAGTATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAAAAAATACAGTAAAAAATATAGGTGATCTTCTTTCAAGCAGTATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCGAACAGCAACGCTCCGAAAGACAGCATCTGAAAATTCACAAAGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCGAACAGCAACGCTCCGAAAGACAGCATCTGAAAATTCACAAAGAATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACTCTGTTAAGAAGACGCTAACCGAACTAAAGAGTGACTTCGACAAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACTCTGTTAAGAAGACGCTAACCGAACTAAAGAGTGACTTCGACAAACAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACAGATAGATTTCTAAGCTTAGAAAGTGACAGAGCCAAAGTTCTGAAGAC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100451 ACAGATAGATTTCTAAGCTTAGAAGGTGACAGAGCCAAAGTTCTGAAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGACTTTTGCAAATGATCTAAAACCAAAGGTGTATAATCTAAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGACTTTTGCAAATGATCTAAAACCAAAGGTGTATAATCTAAAGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTTTCCCGTTTAGAACCATTAGTAAATGATTTAACACTACGCATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTTTCCCGTTTAGAACCATTAGTAAATGATTTAACACTACGCATTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGATTGGTTACCGACTTACTACAAAGAGAGAAAGAAATTGCTTTCTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGATTGGTTACCGACTTACTACAAAGAGAGAAAGAAATTGCTTTCTTAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAAAAAATATCTAATTTAACAATAGTCCAAGCTGAGATTAAGGATATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGAAAAAATATCTAATTTAACAATAGTCCAAGCTGAGATTAAGGATATTA

    700     .    :    .    :    .    :
    701 AAGATGAAATAGCACACATTTCAGATATGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAGATGAAATAGCACACATTTCAGATATGAAT