seq1 = pF1KE5290.tfa, 756 bp
seq2 = pF1KE5290/gi568815587r_65493346.tfa (gi568815587r:65493346_65695772), 202427 bp

>pF1KE5290 756
>gi568815587r:65493346_65695772 (Chr11)

(complement)

1-319  (100001-100319)   100% ->
320-718  (101899-102297)   100% ->
719-756  (102390-102427)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGGTCTAAGGCCCTGGTCCCGATACGGGCTCCTGGTTGTGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGGTCTAAGGCCCTGGTCCCGATACGGGCTCCTGGTTGTGGCCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCTGGCCCTGGGGCTTGGGGCTGTGGTGTTCCAGGCCCTGGAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGCTGGCCCTGGGGCTTGGGGCTGTGGTGTTCCAGGCCCTGGAGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCCTGCATGCAGGCTTCAGGCTGAGCTCAGGGCAGAGCTGGCAGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCCTGCATGCAGGCTTCAGGCTGAGCTCAGGGCAGAGCTGGCAGCCTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGCAGAGCATAGGGCCTGCCTGCCACCCGGAGCTCTGGAAGAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGCAGAGCATAGGGCCTGCCTGCCACCCGGAGCTCTGGAAGAGCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCACTGCCCTGGCCACCCAGGCCCATGGGGTCTCCACCCTGGGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCACTGCCCTGGCCACCCAGGCCCATGGGGTCTCCACCCTGGGCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTCAGAGGGCAGGACCTGGGACCTTCCCTCAGCCCTGCTCTTCGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTCAGAGGGCAGGACCTGGGACCTTCCCTCAGCCCTGCTCTTCGCTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCATCCTCACCACCACAG         GTTATGGCCACATGGCCCCACT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100301 AGCATCCTCACCACCACAGGTA...CAGGTTATGGCCACATGGCCCCACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATCGCCAGGCGGAAAGGCCTTCTGCATGGTCTATGCAGCCCTGGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101921 ATCGCCAGGCGGAAAGGCCTTCTGCATGGTCTATGCAGCCCTGGGGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CAGCCTCCTTAGCTCTCGTGGCCACCCTGCGCCATTGCCTGCTGCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101971 CAGCCTCCTTAGCTCTCGTGGCCACCCTGCGCCATTGCCTGCTGCCTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CTCAGCCGCCCACGTGCCTGGGTAGCGGTCCACTGGCAGCTGTCACCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102021 CTCAGCCGCCCACGTGCCTGGGTAGCGGTCCACTGGCAGCTGTCACCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CAGGGCTGCGCTGCTGCAGGCAGTTGCACTGGGACTGCTGGTGGCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102071 CAGGGCTGCGCTGCTGCAGGCAGTTGCACTGGGACTGCTGGTGGCCAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GCTTTGTGCTGCTGCCAGCGCTGGTGCTGTGGGGCCTTCAGGGCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102121 GCTTTGTGCTGCTGCCAGCGCTGGTGCTGTGGGGCCTTCAGGGCGACTGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AGCCTGCTGGGGGCCGTCTACTTCTGCTTCAGCTCGCTCAGCACCATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102171 AGCCTGCTGGGGGCCGTCTACTTCTGCTTCAGCTCGCTCAGCACCATTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCTGGAGGACTTGCTGCCCGGCCGCGGCCGCAGCCTGCACCCCGTGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102221 CCTGGAGGACTTGCTGCCCGGCCGCGGCCGCAGCCTGCACCCCGTGATTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACCACCTGGGCCAGCTCGCACTTCTTG         GTGGAGGGACCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102271 ACCACCTGGGCCAGCTCGCACTTCTTGGTA...CAGGTGGAGGGACCTCA

    750     .    :    .    :
    733 CTCCAGGGCACGGCGTGGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||
 102404 CTCCAGGGCACGGCGTGGGAGGGG