seq1 = pF1KE5283.tfa, 768 bp
seq2 = pF1KE5283/gi568815592r_166829591.tfa (gi568815592r:166829591_167056182), 226592 bp

>pF1KE5283 768
>gi568815592r:166829591_167056182 (Chr6)

(complement)

1-86  (100001-100086)   100% ->
87-147  (103635-103695)   100% ->
148-203  (107558-107613)   100% ->
204-261  (109444-109501)   100% ->
262-332  (113094-113164)   100% ->
333-446  (117175-117288)   100% ->
447-492  (122047-122092)   100% ->
493-567  (125065-125139)   100% ->
568-768  (126392-126592)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCCCTGCAGCCCTGCGCGGGGCCCTGCTGGGCTGCCTCTGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCCCTGCAGCCCTGCGCGGGGCCCTGCTGGGCTGCCTCTGCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGCTTTGCCTGGGCGGTGCGGACAAGCGCCTGCG         TGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100051 GTTGCTTTGCCTGGGCGGTGCGGACAAGCGCCTGCGGTG...CAGTGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCATGAGTGGAAAAAACTAATTATGGTTCAGCACTGGCCTGAGACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103640 ACCATGAGTGGAAAAAACTAATTATGGTTCAGCACTGGCCTGAGACAGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCGAG         AAAATTCAAAACGACTGTAGAGACCCTCCGGATTA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103690 TGCGAGGTG...TAGAAAATTCAAAACGACTGTAGAGACCCTCCGGATTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTGGACAATACATGGACTATG         GCCCGATAAAAGTGAAGGAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 107593 CTGGACAATACATGGACTATGGCA...CAGGCCCGATAAAAGTGAAGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GTAATAGATCGTGGCCCTTCAATTTAGAAGAGATTAAG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 109464 GTAATAGATCGTGGCCCTTCAATTTAGAAGAGATTAAGGTA...TAGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 CTTTTGCCAGAAATGAGGGCATACTGGCCTGACGTAATTCACTCGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113097 CTTTTGCCAGAAATGAGGGCATACTGGCCTGACGTAATTCACTCGTTTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CAATCGCAGCCGCTTCTG         GAAGCATGAGTGGGAAAAGCATG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 113147 CAATCGCAGCCGCTTCTGGTA...CAGGAAGCATGAGTGGGAAAAGCATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 GGACCTGCGCCGCCCAGGTGGATGCGCTCAACTCCCAGAAGAAGTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117198 GGACCTGCGCCGCCCAGGTGGATGCGCTCAACTCCCAGAAGAAGTACTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GGCAGAAGCCTGGAACTCTACAGGGAGCTGGACCTCAACAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 117248 GGCAGAAGCCTGGAACTCTACAGGGAGCTGGACCTCAACAGGTG...TAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TGTGCTTCTAAAATTGGGGATAAAACCATCCATCAATTACTACCAA    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 122047 TGTGCTTCTAAAATTGGGGATAAAACCATCCATCAATTACTACCAAGTA.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    493      GTTGCAGATTTTAAAGATGCCCTTGCCAGAGTATATGGAGTGATA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122097 ..CAGGTTGCAGATTTTAAAGATGCCCTTGCCAGAGTATATGGAGTGATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 CCCAAAATCCAGTGCCTTCCACCAAGCCAG         GATGAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 125110 CCCAAAATCCAGTGCCTTCCACCAAGCCAGGTT...TAGGATGAGGAAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    579 ACAGACAATTGGTCAGATAGAACTGTGCCTCACTAAGCAAGACCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126403 ACAGACAATTGGTCAGATAGAACTGTGCCTCACTAAGCAAGACCAGCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    629 TGCAAAACTGCACCGAGCCGGGGGAGCAGCCGTCCCCCAAGCAGGAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126453 TGCAAAACTGCACCGAGCCGGGGGAGCAGCCGTCCCCCAAGCAGGAAGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 TGGCTGGCAAATGGGGCCGCCGAGAGCCGGGGTCTGAGAGTCTGTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126503 TGGCTGGCAAATGGGGCCGCCGAGAGCCGGGGTCTGAGAGTCTGTGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    729 TGGCCCAGTCTTCTATCCCCCACCTAAAAAGACCAAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126553 TGGCCCAGTCTTCTATCCCCCACCTAAAAAGACCAAGCAT