seq1 = pF1KE5266.tfa, 576 bp
seq2 = pF1KE5266/gi568815579f_13777249.tfa (gi568815579f:13777249_13980500), 203252 bp

>pF1KE5266 576
>gi568815579f:13777249_13980500 (Chr19)

1-517  (100001-100517)   100% ->
518-576  (103194-103252)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGACCTTTGACCTGTGGACAGATTACCTGGGTTTGGCACACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGACCTTTGACCTGTGGACAGATTACCTGGGTTTGGCACACCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAGGGCTCTGAGTGGGAAAGAGGGTCCTGAAACCAGGCTGAGCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAGGGCTCTGAGTGGGAAAGAGGGTCCTGAAACCAGGCTGAGCCCCCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAGCCAGAGCCAATGCTGGAGCCGGTGTCAGCCCTGGAGCCGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGAGCCAGAGCCAATGCTGGAGCCGGTGTCAGCCCTGGAGCCGATGCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCGCCGGAGTCGGTGCCAGTGCCGGGACCCAAGGATCAGAAGCGCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCGCCGGAGTCGGTGCCAGTGCCGGGACCCAAGGATCAGAAGCGCAGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGTCCTCGCCAGCTCCCGAACGCCTGTGCTCTTTCTGCAAACACAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGTCCTCGCCAGCTCCCGAACGCCTGTGCTCTTTCTGCAAACACAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGAGTCCCGGGCCATCTACCAGTCCCACGTGCTGAAGGACGAGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGAGTCCCGGGCCATCTACCAGTCCCACGTGCTGAAGGACGAGGCTGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGGTGCTGTGTCCCATCCTGCGGGACTACGTGTGTCCCCAGTGCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGGTGCTGTGTCCCATCCTGCGGGACTACGTGTGTCCCCAGTGCGGCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACACGTGAGCGCGCCCACACCCGACGCTTCTGCCCACTTACTGGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACACGTGAGCGCGCCCACACCCGACGCTTCTGCCCACTTACTGGCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTACACCTCCGTCTACAGCCACACCACCCGAAACTCGGCAGGCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTACACCTCCGTCTACAGCCACACCACCCGAAACTCGGCAGGCAAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGTCCGGCCTGACAAGGCGAAGACACAGGACACAGGCCACCGCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGTCCGGCCTGACAAGGCGAAGACACAGGACACAGGCCACCGCCGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGGAGGAGGAGGAGCAG         GTTTCAGAGGTGCCGGGAAGTCTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100501 AGGAGGAGGAGGAGCAGGTG...TAGGTTTCAGAGGTGCCGGGAAGTCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .
    542 AGCCTTCGCCCTCCTGCTCTCCCTCCATGTCCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103218 AGCCTTCGCCCTCCTGCTCTCCCTCCATGTCCACC