seq1 = pF1KE5263.tfa, 516 bp
seq2 = pF1KE5263/gi568815589f_133360067.tfa (gi568815589f:133360067_133568650), 208584 bp

>pF1KE5263 516
>gi568815589f:133360067_133568650 (Chr9)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-194  (103417-103489)   98% ->
195-320  (105256-105381)   100% ->
321-428  (107855-107962)   100% ->
429-516  (108497-108584)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAGCTCAGGTGGGGCGCCCGGGGCGTCCGCCAGCTCTGCGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCAGCTCAGGTGGGGCGCCCGGGGCGTCCGCCAGCTCTGCGCCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGCAGGAAGAGGGCATGACGTGGTGGTACCGCTGGCTGTGTCGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGCAGGAAGAGGGCATGACGTGGTGGTACCGCTGGCTGTGTCGCCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGGGGTGCTGGGGGCAGTCT         CTTGCGCGATCTCTGGCCTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 CTGGGGTGCTGGGGGCAGTCTGTG...AAGCTTGCGCGATCTCTGGCCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCAACTGCATCACCATCCACCCTCTGAACATCGCGGCCGGCGTGTGGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 103437 TTCAACTGCATCACCATCCACCCTCTGAACATTGCGGCCGGCGTGTGGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAT         CATGAATGCCTTCATCTTGTTGCTGTGTGAGGCGCCCT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103487 GATGTG...CAGCATGAATGCCTTCATCTTGTTGCTGTGTGAGGCGCCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTGCTGCCAGTTCATCGAGTTTGCAAACACAGTGGCGGAGAAGGTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105294 TCTGCTGCCAGTTCATCGAGTTTGCAAACACAGTGGCGGAGAAGGTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGGCTGCGCTCCTGGCAGAAGGCTGTCTTCTACTGCGG         GAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105344 CGGCTGCGCTCCTGGCAGAAGGCTGTCTTCTACTGCGGGTG...CAGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCGGTCGTTCCCATCGTCATCAGCCTGACCCTGACCACGCTGCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107858 GGCGGTCGTTCCCATCGTCATCAGCCTGACCCTGACCACGCTGCTGGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACGCCATCGCCTTTGCTACGGGGGTGCTGTACGGACTCTCTGCTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107908 ACGCCATCGCCTTTGCTACGGGGGTGCTGTACGGACTCTCTGCTCTGGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAAAA         GGGCGATGCGATCTCCTATGCCAGGATCCAGCAGCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107958 AAAAAGTG...CAGGGGCGATGCGATCTCCTATGCCAGGATCCAGCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAGGCAGCAGGCGGATGAGGAGAAGCTCGCGGAGACCCTGGAGGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108533 GAGGCAGCAGGCGGATGAGGAGAAGCTCGCGGAGACCCTGGAGGGGGAGC

    550 
    515 TG
        ||
 108583 TG