seq1 = pF1KE5257.tfa, 624 bp
seq2 = pF1KE5257/gi568815593r_44204998.tfa (gi568815593r:44204998_44488682), 283685 bp

>pF1KE5257 624
>gi568815593r:44204998_44488682 (Chr5)

(complement)

1-325  (100001-100325)   100% ->
326-429  (178153-178256)   100% ->
430-624  (183491-183685)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGAAATGGATACTGACACATTGTGCCTCAGCCTTTCCCCACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGAAATGGATACTGACACATTGTGCCTCAGCCTTTCCCCACCTGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCTGCTGCTGCTGCTGCTTTTTGTTGCTGTTCTTGGTGTCTTCCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCTGCTGCTGCTGCTGCTTTTTGTTGCTGTTCTTGGTGTCTTCCGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTCACCTGCCAAGCCCTTGGTCAGGACATGGTGTCACCAGAGGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTCACCTGCCAAGCCCTTGGTCAGGACATGGTGTCACCAGAGGCCACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AACTCTTCTTCCTCCTCCTTCTCCTCTCCTTCCAGCGCGGGAAGGCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AACTCTTCTTCCTCCTCCTTCTCCTCTCCTTCCAGCGCGGGAAGGCATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGGAGCTACAATCACCTTCAAGGAGATGTCCGCTGGAGAAAGCTATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGGAGCTACAATCACCTTCAAGGAGATGTCCGCTGGAGAAAGCTATTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTTCACCAAGTACTTTCTCAAGATTGAGAAGAACGGGAAGGTCAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTTCACCAAGTACTTTCTCAAGATTGAGAAGAACGGGAAGGTCAGCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACCAAGAAGGAGAACTGCCCGTACA         GCATCCTGGAGATAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100301 ACCAAGAAGGAGAACTGCCCGTACAGTA...TAGGCATCCTGGAGATAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 ATCAGTAGAAATCGGAGTTGTTGCCGTCAAAGCCATTAACAGCAACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178169 ATCAGTAGAAATCGGAGTTGTTGCCGTCAAAGCCATTAACAGCAACTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTTAGCCATGAACAAGAAGGGGAAACTCTATGGCTCA         AAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 178219 ACTTAGCCATGAACAAGAAGGGGAAACTCTATGGCTCAGTA...CAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAATTTAACAATGACTGTAAGCTGAAGGAGAGGATAGAGGAAAATGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183494 GAATTTAACAATGACTGTAAGCTGAAGGAGAGGATAGAGGAAAATGGATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CAATACCTATGCATCATTTAACTGGCAGCATAATGGGAGGCAAATGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183544 CAATACCTATGCATCATTTAACTGGCAGCATAATGGGAGGCAAATGTATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGCATTGAATGGAAAAGGAGCTCCAAGGAGAGGACAGAAAACACGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183594 TGGCATTGAATGGAAAAGGAGCTCCAAGGAGAGGACAGAAAACACGAAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAAAACACCTCTGCTCACTTTCTTCCAATGGTGGTACACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183644 AAAAACACCTCTGCTCACTTTCTTCCAATGGTGGTACACTCA