seq1 = pF1KE5255.tfa, 519 bp
seq2 = pF1KE5255/gi568815597r_110301526.tfa (gi568815597r:110301526_110507866), 206341 bp

>pF1KE5255 519
>gi568815597r:110301526_110507866 (Chr1)

(complement)

1-281  (100001-100281)   100% ->
282-343  (101488-101549)   100% ->
344-461  (103831-103948)   100% ->
462-519  (106284-106341)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCAGGTGCAGGTCACCTCGACGGTCACCGCGCGGGGAGCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCAGGTGCAGGTCACCTCGACGGTCACCGCGCGGGGAGCCCAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCGTCAGGCTCTGTGCGACGGAAGCGCAGTGATGTTTTCCAGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTCGTCAGGCTCTGTGCGACGGAAGCGCAGTGATGTTTTCCAGTAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACGCGGACGTTGCACCGTGATCAATTTTGTCCCTTTGGAGGCGCCGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AACGCGGACGTTGCACCGTGATCAATTTTGTCCCTTTGGAGGCGCCGTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGTCCACGCCCCGCTCGCGTCAAGTGACTGAGGCCTGTGGTGGAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGTCCACGCCCCGCTCGCGTCAAGTGACTGAGGCCTGTGGTGGAGAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGTGCCGTGCCGCTGGGTTCTGAGCCGGAGTGGTCGGTGGGTGGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGTGCCGTGCCGCTGGGTTCTGAGCCGGAGTGGTCGGTGGGTGGGATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCGACCTTGGAGCAGCACTTGGAAGACAC         AATGAAGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100251 AGGCGACCTTGGAGCAGCACTTGGAAGACACGTG...TAGAATGAAGAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCCTCCATTGTTGGAGTCCTGTGCACAGATTCACAAGGACTTAATCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101498 CCCTCCATTGTTGGAGTCCTGTGCACAGATTCACAAGGACTTAATCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TT         GCCGCGGGACCCTGTCAGATGAGCATGCTGGAGTGATAT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101548 TTGTA...CAGGCCGCGGGACCCTGTCAGATGAGCATGCTGGAGTGATAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGTTCTAGCCCAGCAAGCAGCTAAGCTAACCTCTGACCCCACTGATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103870 CTGTTCTAGCCCAGCAAGCAGCTAAGCTAACCTCTGACCCCACTGATATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCTGTGGTGTGTCTAGAATCAGATAATGG         GAACATTATGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 103920 CCTGTGGTGTGTCTAGAATCAGATAATGGGTG...CAGGAACATTATGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    474 CCAGAAACACGATGGCATCACGGTGGCAGTGCACAAAATGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106296 CCAGAAACACGATGGCATCACGGTGGCAGTGCACAAAATGGCCTCT