seq1 = pF1KE5254.tfa, 636 bp
seq2 = pF1KE5254/gi568815578r_33607709.tfa (gi568815578r:33607709_33820207), 212499 bp

>pF1KE5254 636
>gi568815578r:33607709_33820207 (Chr20)

(complement)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-176  (105472-105534)   100% ->
177-375  (109455-109653)   100% ->
376-636  (112239-112499)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGCCCCGCCGCAGCTAAGGGCTCTGCTCGTAGTCGTCAACGCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGCCCCGCCGCAGCTAAGGGCTCTGCTCGTAGTCGTCAACGCACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCGCAAGCGCCGCTACCACGCTGCGTTGGCCGTGCTTAAGGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCGCAAGCGCCGCTACCACGCTGCGTTGGCCGTGCTTAAGGGCTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGAACGGGGCTGT         CTATGGAGCCAAAATCCGGGCCCCTCAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGAACGGGGCTGTGTG...CAGCTATGGAGCCAAAATCCGGGCCCCTCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGCTGGTCATGACCTTTCTCTTCCGGAATGGCAG         CCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105500 GCGCTGGTCATGACCTTTCTCTTCCGGAATGGCAGGTA...CAGCCTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAGAAGCTGTGGGCCATACTGCAGGCCACATATATCCACTCCTGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109461 GGAGAAGCTGTGGGCCATACTGCAGGCCACATATATCCACTCCTGGAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGCACGGTTTGTGTTCACCTACAAGGGTCTCCGTGCCCTGCAGTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109511 TGGCACGGTTTGTGTTCACCTACAAGGGTCTCCGTGCCCTGCAGTCCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATACAAGGCAAGACCTACCCAGCACACGCATTCCTGGCGGCCTTCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109561 ATACAAGGCAAGACCTACCCAGCACACGCATTCCTGGCGGCCTTCCTCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGGTATCCTGGTGTTTGGAGAAAACAATAACATCAACAGCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 109611 GGGTATCCTGGTGTTTGGAGAAAACAATAACATCAACAGCCAGGTA...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376   ATCAACATGTACCTGTTGTCACGCGTCCTGTTTGCCCTGAGCCGCCTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112237 AGATCAACATGTACCTGTTGTCACGCGTCCTGTTTGCCCTGAGCCGCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTGTAGAGAAGGGCTACATCCCTGAACCCAGGTGGGACCCGTTCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112287 GCTGTAGAGAAGGGCTACATCCCTGAACCCAGGTGGGACCCGTTCCCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCTCACTGCGGTGGTGTGGGGGCTGGTGCTGTGGCTCTTTGAGTATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112337 GCTCACTGCGGTGGTGTGGGGGCTGGTGCTGTGGCTCTTTGAGTATCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GATCCACCCTGCAGCCCTCGCTGCAGTCCTCCATGACCTACCTCTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112387 GATCCACCCTGCAGCCCTCGCTGCAGTCCTCCATGACCTACCTCTATGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACAGCAATGTATGGCACGACATCTCAGACTTCCTCATCTATAACAAGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 112437 GACAGCAATGTATGGCACGACATCTCAGACTTCCTCGTCTATAACAAGAG

    650     .    :
    624 CCGTCCCTCCAAT
        |||||||||||||
 112487 CCGTCCCTCCAAT