seq1 = pF1KE5250.tfa, 582 bp
seq2 = pF1KE5250/gi568815588r_30511958.tfa (gi568815588r:30511958_30729705), 217748 bp

>pF1KE5250 582
>gi568815588r:30511958_30729705 (Chr10)

(complement)

1-113  (100001-100113)   100% ->
114-277  (102766-102929)   100% ->
278-436  (103443-103601)   100% ->
437-515  (116806-116884)   98% ->
516-582  (117682-117748)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGGACGCTCCCCTGAGCTGCCTGTCACCGACTAAGTGGAGCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGGACGCTCCCCTGAGCTGCCTGTCACCGACTAAGTGGAGCAGTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCTTCCGCAGACTCAACTGAGAAGTCAGCCTCTGCGGCAGGCACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCTTCCGCAGACTCAACTGAGAAGTCAGCCTCTGCGGCAGGCACCAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCTGCCTTTTCA         GTTCTGTCTCCGGCAGGCTTTGAGGATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCTGCCTTTTCAGTA...CAGGTTCTGTCTCCGGCAGGCTTTGAGGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGGCTGCGGGCATTCTGACCCTCATTGGCTGCCTGGTCACAGGCGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102794 AAGGCTGCGGGCATTCTGACCCTCATTGGCTGCCTGGTCACAGGCGCCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTCCAAAATCTACACTCGTTGCAAACTGGCAAAAATATTCTCGAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102844 GTCCAAAATCTACACTCGTTGCAAACTGGCAAAAATATTCTCGAGGGCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCTGGACAATTACTGGGGCTTCAGCCTTGGAAACT         GGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102894 GCCTGGACAATTACTGGGGCTTCAGCCTTGGAAACTGTG...CAGGGATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGCATGGCGTATTATGAGAGCGGCTACAACACCACAGCCCAGACGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103448 TGCATGGCGTATTATGAGAGCGGCTACAACACCACAGCCCAGACGGTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGATGACGGCAGCATCGACTACGGCATCTTCCAGATCAACAGCTTCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103498 GGATGACGGCAGCATCGACTACGGCATCTTCCAGATCAACAGCTTCGCGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGTGCAGACGCGGAAAGCTGAAGGAGAACAACCACTGCCACGTCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103548 GGTGCAGACGCGGAAAGCTGAAGGAGAACAACCACTGCCACGTCGCCTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCAG         CCTTGGTCACTGATGACCTCACAGATGCGATTATCTG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103598 TCAGGTG...CAGCCTTGGTCACTGATGACCTCACAGATGCGATTATCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCCAAGAAAATTGTTAAAGAGACACAAGGAATGAATTATTG        
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||>>>...>>
 116843 TGCCAAGAAAATTGTTAAAGAGACACAAGGAATGAACTATTGGTA...CA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    516  GCAAGGCTGGAAGAAACACTGTGAGGGGAGAGACCTGTCCGACTGGAAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117681 GGCAAGGCTGGAAGAAACACTGTGAGGGGAGAGACCTGTCCGACTGGAAA

    600     .    :    .
    565 AAAGACTGTGAGGTTTCC
        ||||||||||||||||||
 117731 AAAGACTGTGAGGTTTCC