seq1 = pF1KE5241.tfa, 750 bp
seq2 = pF1KE5241/gi568815591r_66888374.tfa (gi568815591r:66888374_67095417), 207044 bp

>pF1KE5241 750
>gi568815591r:66888374_67095417 (Chr7)

(complement)

1-128  (100001-100128)   100% ->
129-258  (101077-101206)   100% ->
259-459  (102001-102201)   100% ->
460-624  (104117-104281)   100% ->
625-750  (106919-107044)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGATCTTCACCCCCACCAACCAGATCCGCCTAACCAATGTGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGATCTTCACCCCCACCAACCAGATCCGCCTAACCAATGTGGCCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTACGGATGAAGCGTGCCGGGAAGCGCTTCGAAATCGCCTGCTACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTACGGATGAAGCGTGCCGGGAAGCGCTTCGAAATCGCCTGCTACAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAAGGTCGTCGGCTGGCGGAGCGGCGT         GGAAAAAGACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100101 ACAAGGTCGTCGGCTGGCGGAGCGGCGTGTG...AAGGGAAAAAGACCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATGAAGTTCTGCAGACCCACTCAGTGTTTGTAAATGTTTCTAAAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101090 GATGAAGTTCTGCAGACCCACTCAGTGTTTGTAAATGTTTCTAAAGGTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGTTGCCAAAAAGGAAGATCTCATCAGTGCGTTTGGAACAGATGACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101140 GGTTGCCAAAAAGGAAGATCTCATCAGTGCGTTTGGAACAGATGACCAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGAAATCTGTAAGCAG         ATTTTGACTAAAGGAGAAGTTCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 101190 CTGAAATCTGTAAGCAGGTG...TAGATTTTGACTAAAGGAGAAGTTCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTATCAGATAAAGAAAGACACACACAACTGGAGCAGATGTTTAGGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102025 GTATCAGATAAAGAAAGACACACACAACTGGAGCAGATGTTTAGGGACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCAACTATTGTGGCAGACAAATGTGTGAATCCTGAAACAAAGAGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102075 TGCAACTATTGTGGCAGACAAATGTGTGAATCCTGAAACAAAGAGACCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACACCGTGATCCTTATTGAGAGAGCCATGAAGGACATCCACTATTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102125 ACACCGTGATCCTTATTGAGAGAGCCATGAAGGACATCCACTATTCGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAACCAACAAGAGTACAAAACAGCAG         GCTTTGGAAGTGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102175 AAAACCAACAAGAGTACAAAACAGCAGGTG...TAGGCTTTGGAAGTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAGCAGTTAAAAGAGAAAATGAAGATAGAACGTGCTCACATGAGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104131 AAAGCAGTTAAAAGAGAAAATGAAGATAGAACGTGCTCACATGAGGCTTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGTTCATCCTTCCAGTCAATGAAGGCAAGAAGCTGAAAGAAAAGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104181 GGTTCATCCTTCCAGTCAATGAAGGCAAGAAGCTGAAAGAAAAGCTCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CCACTGATCAAGGTCATAGAAAGTGAAGATTATGGCCAACAGTTAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104231 CCACTGATCAAGGTCATAGAAAGTGAAGATTATGGCCAACAGTTAGAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 C         GTATGTCTGATTGACCCGGGCTGCTTCCGAGAAATTGATG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104281 CGTA...CAGGTATGTCTGATTGACCCGGGCTGCTTCCGAGAAATTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGCTAATAAAAAAGGAAACTAAAGGCAAAGGTTCTTTGGAAGTACTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106959 AGCTAATAAAAAAGGAAACTAAAGGCAAAGGTTCTTTGGAAGTACTCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .
    715 CTGAAAGATGTAGAAGAAGGAGATGAGAAATTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107009 CTGAAAGATGTAGAAGAAGGAGATGAGAAATTTGAA