seq1 = pF1KE5229.tfa, 558 bp
seq2 = pF1KE5229/gi568815588r_117032212.tfa (gi568815588r:117032212_117238056), 205845 bp

>pF1KE5229 558
>gi568815588r:117032212_117238056 (Chr10)

(complement)

1-241  (100001-100241)   100% ->
242-429  (101398-101585)   100% ->
430-467  (105580-105617)   100% ->
468-558  (105755-105845)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCGGGAAACCAGACAAAATGGACGTTCGATGCCACTCGGACGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCGGGAAACCAGACAAAATGGACGTTCGATGCCACTCGGACGCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCTGCCCGGGTCTCGAAGAACGCGCACAAGGAGAGTCGGGAGAGCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCTGCCCGGGTCTCGAAGAACGCGCACAAGGAGAGTCGGGAGAGCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGCGGAGGGGAACCTCCCAGCCGCCTTCCTCAAGGAGCCGCAGGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCGGAGGGGAACCTCCCAGCCGCCTTCCTCAAGGAGCCGCAGGGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCTCAGCGTCGGGCGCTGCTGAGGATTGTAACAAAAGTAAATCCAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCTCAGCGTCGGGCGCTGCTGAGGATTGTAACAAAAGTAAATCCAATTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCAGCGGACCCGGATTACTGCCGCCGGATCCTGGTCCGAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100201 CGCAGCGGACCCGGATTACTGCCGCCGGATCCTGGTCCGAGGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATGCCAAGGGGTCCATCCGAGAGATCATCCTGCCCAAGGGCCTGGACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101398 ATGCCAAGGGGTCCATCCGAGAGATCATCCTGCCCAAGGGCCTGGACTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCGGCCTAAGAGGACGCGCACGTCCTTCACCGCGGAGCAGCTCTATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101448 GACCGGCCTAAGAGGACGCGCACGTCCTTCACCGCGGAGCAGCTCTATCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTGGAGATGGAGTTCCAGCGCTGCCAGTACGTGGTGGGCCGCGAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101498 GCTGGAGATGGAGTTCCAGCGCTGCCAGTACGTGGTGGGCCGCGAGAGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCGAGCTCGCCCGGCAGCTTAACCTCTCCGAGACCCAG         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 101548 CCGAGCTCGCCCGGCAGCTTAACCTCTCCGAGACCCAGGTA...TAGGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AATAGTGAAGAAAATAATGAACGATTCAAACGCGG         GATAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105583 AATAGTGAAGAAAATAATGAACGATTCAAACGCGGGTA...AAGGATAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAAACAAAAGAAGAAAAGGAAGAAAGAGCCAGCAAATGATGAGTCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105761 AAAACAAAAGAAGAAAAGGAAGAAAGAGCCAGCAAATGATGAGTCTCGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .
    524 GTGGGGACTCCGGGGGCAGAGGGTGGCAGCCCCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105811 GTGGGGACTCCGGGGGCAGAGGGTGGCAGCCCCTA