seq1 = pF1KE5222.tfa, 768 bp
seq2 = pF1KE5222/gi568815581r_75166743.tfa (gi568815581r:75166743_75370195), 203453 bp

>pF1KE5222 768
>gi568815581r:75166743_75370195 (Chr17)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-184  (100748-100849)   100% ->
185-294  (102004-102113)   100% ->
295-450  (102295-102450)   100% ->
451-543  (102566-102658)   100% ->
544-768  (103229-103453)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGAGCCCAGTAGAGAGGAGTATAAAATCCAGTCCTTTGATGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGGAGCCCAGTAGAGAGGAGTATAAAATCCAGTCCTTTGATGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCCAGCAGCTGCTGAAGACAGCACTCAAAG         TTGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 GACCCAGCAGCTGCTGAAGACAGCACTCAAAGGTG...CAGTTGCCTGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TTGAGACAGAAGATGGAGAATATTCCGTTTGCCAGAGGAGCTATAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100757 TTGAGACAGAAGATGGAGAATATTCCGTTTGCCAGAGGAGCTATAGTAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCTCTCGCCTGATGCCTTCCCGCTGTAACACGCAGTACAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100807 TGCTCTCGCCTGATGCCTTCCCGCTGTAACACGCAGTACAGAGGTT...T

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    185   ATCCGGGTGCTGTGGACTTGGAGAAAGTGGCCAATGTGATTGTGGACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102002 AGATCCGGGTGCTGTGGACTTGGAGAAAGTGGCCAATGTGATTGTGGACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTCTCTGCAGGACTGTGTGTTCAGCAAGGAAGCAGGACGCATGTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102052 ATTCTCTGCAGGACTGTGTGTTCAGCAAGGAAGCAGGACGCATGTGCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCCATCATTCAG         GCAGAGAGTAAACAAGCAGGCCAGAGTGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 102102 GCCATCATTCAGGTT...CAGGCAGAGAGTAAACAAGCAGGCCAGAGTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTTCCGACGTGGACTCCTCAACCGGCTGCAGCAGGAGTACCAGGCTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102324 CTTCCGACGTGGACTCCTCAACCGGCTGCAGCAGGAGTACCAGGCTCGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCAGCTGCGAGCACGCTCCCTGCAGGGCTGGGTCTGCTATGTCACCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102374 AGCAGCTGCGAGCACGCTCCCTGCAGGGCTGGGTCTGCTATGTCACCTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCTGCAACATCTTTGACTACCTGAGG         GTGAACAACATGCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102424 ATCTGCAACATCTTTGACTACCTGAGGGTG...CAGGTGAACAACATGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CATGATGGCCCTGGTGAACCCTGTCTATGACTGCCTCTTCCGGCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102580 CATGATGGCCCTGGTGAACCCTGTCTATGACTGCCTCTTCCGGCTGGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGCCAGACAGTTTGAGCAAGGAGGAGGAG         GTGGACTGTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102630 AGCCAGACAGTTTGAGCAAGGAGGAGGAGGTG...CAGGTGGACTGTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GTGCTGCAGCTGCACCGGGTTGGGGAGCAGCTGGAGAAAATGAATGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103241 GTGCTGCAGCTGCACCGGGTTGGGGAGCAGCTGGAGAAAATGAATGGGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GCGCATGGATGAGCTCTTTGTGCTGATCCGGGATGGCTTCCTGCTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103291 GCGCATGGATGAGCTCTTTGTGCTGATCCGGGATGGCTTCCTGCTCCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGGCCTCAGCTCCCTGGCCCAGCTGCTGCTGCTGGAGATCATTGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103341 CTGGCCTCAGCTCCCTGGCCCAGCTGCTGCTGCTGGAGATCATTGAGTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CGGGCGGCCGGCTGGAAGACAACGCCAGCTGCCCACAAGTATTACTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103391 CGGGCGGCCGGCTGGAAGACAACGCCAGCTGCCCACAAGTATTACTACAG

    800     .    :
    756 CGAAGTCTCCGAC
        |||||||||||||
 103441 CGAAGTCTCCGAC