seq1 = pF1KE5217.tfa, 612 bp
seq2 = pF1KE5217/gi568815579f_58288138.tfa (gi568815579f:58288138_58494747), 206610 bp

>pF1KE5217 612
>gi568815579f:58288138_58494747 (Chr19)

1-108  (100001-100108)   100% ->
109-318  (104839-105048)   100% ->
319-447  (105222-105350)   100% ->
448-546  (106360-106458)   100% ->
547-612  (106545-106610)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCGAGTGGGAGACAGCAGCACCAGCGGTGGCAGAGACCCCAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCGAGTGGGAGACAGCAGCACCAGCGGTGGCAGAGACCCCAGACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGCTCTTTGGGAAGTGGAGCACCGATGATGTGCAGATCAATGACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAGCTCTTTGGGAAGTGGAGCACCGATGATGTGCAGATCAATGACATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGCAG         GATTACATTGCAGTGAAGGAGAAGTATGCCAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGCAGGTG...CAGGATTACATTGCAGTGAAGGAGAAGTATGCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCTGCCTCACAGTGCAGGGCGGTATGCCGCCAAACGCTTCCGCAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104872 TACCTGCCTCACAGTGCAGGGCGGTATGCCGCCAAACGCTTCCGCAAAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCAGTGTCCCATTGTGGAGCGCCTCACTAACTCCATGATGATGCACGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104922 TCAGTGTCCCATTGTGGAGCGCCTCACTAACTCCATGATGATGCACGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAACAACGGCAAGAAGCTCATGACTGTGCGCATCGTCAAGCATGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104972 GCAACAACGGCAAGAAGCTCATGACTGTGCGCATCGTCAAGCATGCCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAGATCATACACCTGCTCACAGGCGAG         AACCCTCTGCAGGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 105022 GAGATCATACACCTGCTCACAGGCGAGGTA...TAGAACCCTCTGCAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGGTGAACGCCATCATCAACAGTGGTCCCCGGGAGGACTCCACACGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105236 CCTGGTGAACGCCATCATCAACAGTGGTCCCCGGGAGGACTCCACACGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGGGCGCGCCGGGACTGTGAGACGACAGGCTGTGGATGTGTCCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105286 TTGGGCGCGCCGGGACTGTGAGACGACAGGCTGTGGATGTGTCCCCCCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CGCCGTGTGAACCAG         GCCATCTGGCTGCTGTGCACAGGCGC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105336 CGCCGTGTGAACCAGGTG...TAGGCCATCTGGCTGCTGTGCACAGGCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCGTGAGGCTGCCTTCCGGAACATTAAGACCATTGCTGAGTGCCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106386 TCGTGAGGCTGCCTTCCGGAACATTAAGACCATTGCTGAGTGCCTGGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGAGCTCATCAATGCTGCCAAG         GGCTCCTCGAACTCCTAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 106436 ATGAGCTCATCAATGCTGCCAAGGTG...CAGGGCTCCTCGAACTCCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    565 GCCATTAAGAAGAAGGACGAGCTGGAGCGTGTGGCCAAGTCCAACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106563 GCCATTAAGAAGAAGGACGAGCTGGAGCGTGTGGCCAAGTCCAACCGC