seq1 = pF1KE5213.tfa, 732 bp
seq2 = pF1KE5213/gi568815581r_7144188.tfa (gi568815581r:7144188_7351296), 207109 bp

>pF1KE5213 732
>gi568815581r:7144188_7351296 (Chr17)

(complement)

1-102  (100001-100102)   99% ->
103-169  (103954-104020)   100% ->
170-288  (104115-104233)   100% ->
289-360  (104435-104506)   100% ->
361-477  (104927-105043)   100% ->
478-589  (105160-105271)   100% ->
590-674  (106662-106746)   100% ->
675-732  (107052-107109)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGCGGACGCAGTGTCTGCTGGGGCTGCGCACGTTCGTGGCCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGCGGACGCAGTGTCTGCTGGGGCTGCGCACGTTCGTGGCCTTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCAAGCTCTGGAGCTTCTTCATTTACCTTTTGCGGAGGCAGATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100051 CGCCAAGCTCTGGAGCTTCTTCATTTACCTTCTGCGGAGGCAGATCCGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CG         GTAATTCAGTACCAAACTGTTCGATATGATATCCTCCCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGTG...TAGGTAATTCAGTACCAAACTGTTCGATATGATATCCTCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTATCTCCTGTGTCCCGGAATCGGCTAG         CCCAGGTGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 103993 TTATCTCCTGTGTCCCGGAATCGGCTAGGTA...CAGCCCAGGTGAAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAGATCCTGGTGCTGGATCTGGATGAGACACTTATTCACTCCCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104128 GAAGATCCTGGTGCTGGATCTGGATGAGACACTTATTCACTCCCACCATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGGGGTCCTGAGGCCCACAGTCCGGCCTGGTACGCCTCCTGACTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104178 ATGGGGTCCTGAGGCCCACAGTCCGGCCTGGTACGCCTCCTGACTTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCAAG         GTGGTAATAGACAAACATCCTGTCCGGTTTTTTGT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104228 CTCAAGGTG...TAGGTGGTAATAGACAAACATCCTGTCCGGTTTTTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACATAAGAGGCCCCATGTGGATTTCTTCCTGGAAGTG         GTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 104470 ACATAAGAGGCCCCATGTGGATTTCTTCCTGGAAGTGGTG...CAGGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCCAGTGGTACGAGCTGGTGGTGTTTACAGCAAGCATGGAGATCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104931 GCCAGTGGTACGAGCTGGTGGTGTTTACAGCAAGCATGGAGATCTATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TCTGCTGTGGCAGATAAACTGGACAATAGCAGAAGCATTCTTAAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104981 TCTGCTGTGGCAGATAAACTGGACAATAGCAGAAGCATTCTTAAGAGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATATTACAGACAG         CACTGCACTTTGGAGTTGGGCAGCTACA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105031 ATATTACAGACAGGTA...CAGCACTGCACTTTGGAGTTGGGCAGCTACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCAAGGACCTCTCTGTGGTCCACAGTGACCTCTCCAGCATTGTGATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105188 TCAAGGACCTCTCTGTGGTCCACAGTGACCTCTCCAGCATTGTGATCCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GATAACTCCCCAGGGGCTTACAGGAGCCATCCAG         ACAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 105238 GATAACTCCCCAGGGGCTTACAGGAGCCATCCAGGTA...TAGACAATGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CATCCCCATCAAATCCTGGTTCAGTGACCCCAGCGACACAGCCCTTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106669 CATCCCCATCAAATCCTGGTTCAGTGACCCCAGCGACACAGCCCTTCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ACCTGCTCCCAATGCTGGATGCCCTCAG         GTTCACCGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 106719 ACCTGCTCCCAATGCTGGATGCCCTCAGGTA...CAGGTTCACCGCTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    688 GTTCGTTCCGTGCTGAGCCGAAACCTTCACCAACATCGGCTCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107065 GTTCGTTCCGTGCTGAGCCGAAACCTTCACCAACATCGGCTCTGG