seq1 = pF1KE5212.tfa, 555 bp
seq2 = pF1KE5212/gi568815581r_43669612.tfa (gi568815581r:43669612_43878924), 209313 bp

>pF1KE5212 555
>gi568815581r:43669612_43878924 (Chr17)

(complement)

1-125  (100001-100125)   100% ->
126-352  (103987-104213)   100% ->
353-555  (109111-109313)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGCTCGTTCGAGCTCTCGGTGCAGGATCTCAACGACCTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGGCTCGTTCGAGCTCTCGGTGCAGGATCTCAACGACCTGCTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACGGCAGCGGCTGCTACAGCCTCCCGAGCCAGCCCTGCAACGAGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACGGCAGCGGCTGCTACAGCCTCCCGAGCCAGCCCTGCAACGAGGTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCGCGGATCTACGTGGGCAACGC         GTCTGTGGCTCAGGAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100101 CCCCGCGGATCTACGTGGGCAACGCGTG...CAGGTCTGTGGCTCAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCCCCAAGCTGCAGAAACTAGGCATCACCCATGTGCTGAACGCGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104003 ATCCCCAAGCTGCAGAAACTAGGCATCACCCATGTGCTGAACGCGGCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGCAGGTCCTTCATGCACGTCAACACCAATGCCAACTTCTACAAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104053 GGGCAGGTCCTTCATGCACGTCAACACCAATGCCAACTTCTACAAGGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCGGCATCACATACCTGGGCATCAAGGCCAACGACACACAGGAGTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104103 CCGGCATCACATACCTGGGCATCAAGGCCAACGACACACAGGAGTTCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCAGCGCTTACTTTGAAAGGGCTGCCGACTTCATTGACCAGGCTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104153 CTCAGCGCTTACTTTGAAAGGGCTGCCGACTTCATTGACCAGGCTTTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCAAAAGAATG         GCCGGGTGCTCGTCCACTGCCGGGAAGGTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104203 TCAAAAGAATGGTA...CAGGCCGGGTGCTCGTCCACTGCCGGGAAGGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATAGCCGCTCCCCAACGCTAGTTATCGCCTACCTCATGATGCGGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109141 ATAGCCGCTCCCCAACGCTAGTTATCGCCTACCTCATGATGCGGCAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGGACGTCAAGTCTGCCCTGAGCATCGTGAGGCAGAACCGTGAGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109191 ATGGACGTCAAGTCTGCCCTGAGCATCGTGAGGCAGAACCGTGAGATCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCCCAACGATGGCTTCCTGGCCCAGCTCTGCCAGCTCAATGACAGACTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109241 CCCCAACGATGGCTTCCTGGCCCAGCTCTGCCAGCTCAATGACAGACTAG

    550     .    :    .    :
    533 CCAAGGAGGGGAAGTTGAAACCC
        |||||||||||||||||||||||
 109291 CCAAGGAGGGGAAGTTGAAACCC