seq1 = pF1KE5211.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KE5211/gi568815575f_47483416.tfa (gi568815575f:47483416_47686688), 203273 bp

>pF1KE5211 621
>gi568815575f:47483416_47686688 (ChrX)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-201  (101521-101600)   100% ->
202-328  (101790-101916)   100% ->
329-453  (102128-102252)   99% ->
454-621  (103106-103273)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCCTTTGAGCCCCTGGCTTCTGGCATCCTGTTGTTGCTGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCCCTTTGAGCCCCTGGCTTCTGGCATCCTGTTGTTGCTGTGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATAGCCCCCAGCAGGGCCTGCACCTGTGTCCCACCCCACCCACAGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATAGCCCCCAGCAGGGCCTGCACCTGTGTCCCACCCCACCCACAGACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTTCTGCAATTCCGACCTCG         TCATCAGGGCCAAGTTCGTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 CCTTCTGCAATTCCGACCTCGGTG...CAGTCATCAGGGCCAAGTTCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGGACACCAGAAGTCAACCAGACCACCTTATACCAGCGTTATGAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101541 GGGACACCAGAAGTCAACCAGACCACCTTATACCAGCGTTATGAGATCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GATGACCAAG         ATGTATAAAGGGTTCCAAGCCTTAGGGGATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 101591 GATGACCAAGGTA...CAGATGTATAAAGGGTTCCAAGCCTTAGGGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CCGCTGACATCCGGTTCGTCTACACCCCCGCCATGGAGAGTGTCTGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101821 CCGCTGACATCCGGTTCGTCTACACCCCCGCCATGGAGAGTGTCTGCGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACTTCCACAGGTCCCACAACCGCAGCGAGGAGTTTCTCATTGCTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 101871 TACTTCCACAGGTCCCACAACCGCAGCGAGGAGTTTCTCATTGCTGGTG.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    329      GAAAACTGCAGGATGGACTCTTGCACATCACTACCTGCAGTTTCG
        ..>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 101921 ..TAGGAAAACTGCAGGATGGACTCTTGCACATCACTACCTGCAGTTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGCTCCCTGGAACAGCCTGAGCTTAGCTCAGCGCCGGGGCTTCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102173 TGGCTCCCTGGAACAGCCTGAGCTTAGCTCAGCGCCGGGGCTTCACCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCTACACTGTTGGCTGTGAGGAATGCACA         GTGTTTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102223 ACCTACACTGTTGGCTGTGAGGAATGCACAGTG...CAGGTGTTTCCCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTATCCATCCCCTGCAAACTGCAGAGTGGCACTCATTGCTTGTGGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103117 TTTATCCATCCCCTGCAAACTGCAGAGTGGCACTCATTGCTTGTGGACGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCAGCTCCTCCAAGGCTCTGAAAAGGGCTTCCAGTCCCGTCACCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103167 ACCAGCTCCTCCAAGGCTCTGAAAAGGGCTTCCAGTCCCGTCACCTTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGCCTGCCTCGGGAGCCAGGGCTGTGCACCTGGCAGTCCCTGCGGTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103217 TGCCTGCCTCGGGAGCCAGGGCTGTGCACCTGGCAGTCCCTGCGGTCCCA

    650     .
    615 GATAGCC
        |||||||
 103267 GATAGCC