seq1 = pF1KE5207.tfa, 534 bp
seq2 = pF1KE5207/gi568815579f_35055551.tfa (gi568815579f:35055551_35269612), 214062 bp

>pF1KE5207 534
>gi568815579f:35055551_35269612 (Chr19)

1-61  (100001-100061)   98% ->
62-142  (101871-101951)   100% ->
143-199  (102794-102850)   100% ->
200-292  (105159-105251)   100% ->
293-382  (108606-108695)   100% ->
383-412  (110592-110621)   100% ->
413-487  (110701-110775)   100% ->
488-534  (114016-114062)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCCCTCTGGTCGCCTGTGTCTTCTTACCATCGTTGGCCTGATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCCCTCTGGTCGCCTGTGTCTTCTCACCATCGTTGGCCTGATTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCACCAGAG         GACAGACGTTGAAAGATACCACGTCCAGTT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCACCAGAGGTA...CAGGACAGACGTTGAAAGATACCACGTCCAGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTTCAGCAGACTCAACTATCATGGACATTCAGGTCCCGACACGAGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 CTTCAGCAGACTCAACTATCATGGACATTCAGGTCCCGACACGAGCCCCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 G         ATGCAGTCTACACAGAACTCCAGCCCACCTCTCCAACCCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 GGTG...CAGATGCAGTCTACACAGAACTCCAGCCCACCTCTCCAACCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AACCTGGCCTGCTGATG         AAACACCACAACCCCAGACCCAGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102834 AACCTGGCCTGCTGATGGTG...TAGAAACACCACAACCCCAGACCCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CCCAGCAACTGGAAGGAACGGATGGGCCTCTAGTGACAGATCCAGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105183 CCCAGCAACTGGAAGGAACGGATGGGCCTCTAGTGACAGATCCAGAGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CACAAGAGCACCAAAGCAG         CTCATCCCACTGATGACACCAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105233 CACAAGAGCACCAAAGCAGGTA...CAGCTCATCCCACTGATGACACCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GACGCTCTCTGAGAGACCATCCCCAAGCACAGACGTCCAGACAGACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108628 GACGCTCTCTGAGAGACCATCCCCAAGCACAGACGTCCAGACAGACCCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGACCCTCAAGCCATCTG         GTTTTCATGAGGATGACCCCTTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 108678 AGACCCTCAAGCCATCTGGTT...CAGGTTTTCATGAGGATGACCCCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTCTATG         ATGAACACACCCTCCGGAAACGGGGGCTGTTGGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110615 TTCTATGGTA...CAGATGAACACACCCTCCGGAAACGGGGGCTGTTGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 CGCAGCTGTGCTGTTCATCACAGGCATCATCATCCTCACCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 110735 CGCAGCTGTGCTGTTCATCACAGGCATCATCATCCTCACCAGTG...CAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    488 GTGGCAAGTGCAGGCAGCTGTCCCGGTTATGCCGGAATCATTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 114016 GTGGCAAGTGCAGGCAGCTGTCCCGGTTATGCCGGAATCGTTGCAGG