seq1 = pF1KE5206.tfa, 753 bp
seq2 = pF1KE5206/gi568815592r_45803091.tfa (gi568815592r:45803091_46115542), 312452 bp

>pF1KE5206 753
>gi568815592r:45803091_46115542 (Chr6)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-173  (160299-160408)   100% ->
174-299  (166162-166287)   100% ->
300-406  (173890-173996)   100% ->
407-588  (201134-201315)   100% ->
589-753  (212288-212452)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGACTCGGCGACAGCTAACGGGGACGACAGGGACCCCGAGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGACTCGGCGACAGCTAACGGGGACGACAGGGACCCCGAGATCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTTTGTGAAG         GCTGGAATCGATGGAGAAAGCATCGGCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTTTGTGAAGGTA...CAGGCTGGAATCGATGGAGAAAGCATCGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACTGTCCTTTCTCTCAGCGCCTCTTCATGATCCTCTGGCTGAAAGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160327 ACTGTCCTTTCTCTCAGCGCCTCTTCATGATCCTCTGGCTGAAAGGAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTTCAATGTCACCACTGTGGATCTGAAAAG         AAAGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 160377 GTGTTCAATGTCACCACTGTGGATCTGAAAAGGTA...CAGAAAGCCAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGACCTGCACAACCTAGCCCCCGGCACGCACCCGCCCTTCCTGACCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166171 TGACCTGCACAACCTAGCCCCCGGCACGCACCCGCCCTTCCTGACCTTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACGGGGACGTGAAGACAGACGTCAATAAGATCGAGGAGTTCCTGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166221 ACGGGGACGTGAAGACAGACGTCAATAAGATCGAGGAGTTCCTGGAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCTTGACCCCTGAAAA         GTACCCCAAACTGGCTGCAAAACA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 166271 ACCTTGACCCCTGAAAAGTA...CAGGTACCCCAAACTGGCTGCAAAACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCGGGAATCCAACACAGCGGGCATCGACATCTTTTCCAAGTTTTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173914 CCGGGAATCCAACACAGCGGGCATCGACATCTTTTCCAAGTTTTCTGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACATCAAAAATACCAAGCAGCAGAACAATGCTG         CTCTTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 173964 ACATCAAAAATACCAAGCAGCAGAACAATGCTGGTG...CAGCTCTTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGAGGCCTAACCAAGGCTCTAAAGAAATTGGATGACTACCTGAACACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201142 AGAGGCCTAACCAAGGCTCTAAAGAAATTGGATGACTACCTGAACACCCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCTACCAGAGGAGATTGACGCCAACACTTGTGGGGAAGACAAGGGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201192 TCTACCAGAGGAGATTGACGCCAACACTTGTGGGGAAGACAAGGGGTCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GGCGCAAGTTCCTGGATGGGGATGAGCTGACCCTGGCTGACTGCAATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201242 GGCGCAAGTTCCTGGATGGGGATGAGCTGACCCTGGCTGACTGCAATCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTGCCCAAGCTCCATGTGGTCAAG         ATTGTGGCCAAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 201292 TTGCCCAAGCTCCATGTGGTCAAGGTA...TAGATTGTGGCCAAGAAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCGCAACTATGATATCCCGGCTGAGATGACAGGCCTGTGGCGGTACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212305 CCGCAACTATGATATCCCGGCTGAGATGACAGGCCTGTGGCGGTACCTCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAACGCCTATGCCCGTGATGAGTTCACCAACACCTGTGCAGCTGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212355 AGAACGCCTATGCCCGTGATGAGTTCACCAACACCTGTGCAGCTGACAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    706 GAGATCGAGTTGGCCTACGCTGATGTCGCCAAACGCCTCAGCCGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212405 GAGATCGAGTTGGCCTACGCTGATGTCGCCAAACGCCTCAGCCGATCC