seq1 = pF1KE5188.tfa, 387 bp
seq2 = pF1KE5188/gi568815592r_52878473.tfa (gi568815592r:52878473_53084598), 206126 bp

>pF1KE5188 387
>gi568815592r:52878473_53084598 (Chr6)

(complement)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-267  (101894-102025)   100% ->
268-387  (106007-106126)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACGTGGAGGGGACACTGGATCTGCTGGAACTGCTTATCATGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACGTGGAGGGGACACTGGATCTGCTGGAACTGCTTATCATGCATCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCTTAAAACCAGATGATCAGCAAAAGGAAGTGGTTAACATGGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCTTAAAACCAGATGATCAGCAAAAGGAAGTGGTTAACATGGCCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCTATAATTAGATACTTTCCTGTGTTTGAAAAG         ATTTTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 AGGCTATAATTAGATACTTTCCTGTGTTTGAAAAGGTA...CAGATTTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGGGGTCACGGACAAAGCTTTCTTGTTGGTAATCAGCTGAGCCTTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101900 AGGGGTCACGGACAAAGCTTTCTTGTTGGTAATCAGCTGAGCCTTGCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGATTTTACTCCAAACCATTTTAGCTCTAGAAGAGAAAATTCCTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101950 TGTGATTTTACTCCAAACCATTTTAGCTCTAGAAGAGAAAATTCCTAATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCTGTCTGCATTTCCTTTCCTCCAG         GAATACACAGTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 102000 TCCTGTCTGCATTTCCTTTCCTCCAGGTA...CAGGAATACACAGTGAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTAAGTAATATCCCTACAATTAAGAGATTCCTTGAACCTGGCAGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106022 CTAAGTAATATCCCTACAATTAAGAGATTCCTTGAACCTGGCAGCAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAGCCTCCCCCTGATGAAATTTATGTGAGAACCGTCTACAACATCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106072 GAAGCCTCCCCCTGATGAAATTTATGTGAGAACCGTCTACAACATCTTTA

    400     .
    383 GGCCA
        |||||
 106122 GGCCA