seq1 = pF1KE5186.tfa, 237 bp
seq2 = pF1KE5186/gi568815581f_50619733.tfa (gi568815581f:50619733_50837357), 217625 bp

>pF1KE5186 237
>gi568815581f:50619733_50837357 (Chr17)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-166  (117228-117294)   97% ->
167-237  (117555-117625)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTTCGGCCGCGCAGTTGTTGGATGAGTTAATGGGCCGGGACCGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTTCGGCCGCGCAGTTGTTGGATGAGTTAATGGGCCGGGACCGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTAGCCCCGGACGAGAAGCGCAGCAACGTGCGGTGGGACCACGAGA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 CCTAGCCCCGGACGAGAAGCGCAGCAACGTGCGGTGGGACCACGAGAGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       GCGTTTGTAAATATTATCTCTGTGGTTTTTGTCCTGCGGAATTG
        ...>>>--||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...TAG  GTTTGTAAATATTATCTCTGTGGTTTTTGTCCTGCGGAATTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCACAAATACACGTTCTGATCTTG         ATGTATTTGGAAGAGG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 117270 TTCACAAATACACGTTCTGATCTTGGTA...AAGATGTATTTGGAAGAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGATAACATTAGTGATGTCAGCAAATTTTTGGAAGATGACAAGTGGATGG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117571 AGATAACATTAGAGATGTCAGCAAATTTTTGGAAGATGACAAGTGGATGG

    250     .
    233 AGGAG
        |||||
 117621 AGGAG