seq1 = pF1KE5183.tfa, 345 bp
seq2 = pF1KE5183/gi568815587f_710235.tfa (gi568815587f:710235_912833), 202599 bp

>pF1KE5183 345
>gi568815587f:710235_912833 (Chr11)

1-123  (100001-100123)   100% ->
124-172  (101363-101411)   100% ->
173-271  (102301-102399)   100% ->
272-345  (102526-102599)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCTACGTCGCCTCCTACCTGCTGGCTGCCCTAGGGGGCAACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCTACGTCGCCTCCTACCTGCTGGCTGCCCTAGGGGGCAACTCCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCAGCGCCAAGGACATCAAGAAGATCTTGGACAGCGTGGGTATCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCAGCGCCAAGGACATCAAGAAGATCTTGGACAGCGTGGGTATCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGACGACGACCGGCTCAACAAG         GTTATCAGTGAGCTGAAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100101 CGGACGACGACCGGCTCAACAAGGTA...CAGGTTATCAGTGAGCTGAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAAAAAACATTGAAGACGTCATTGCCCAGG         GTATTGGCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 101381 GGAAAAAACATTGAAGACGTCATTGCCCAGGGTG...TAGGTATTGGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTTGCCAGTGTACCTGCTGGTGGGGCTGTAGCCGTCTCTGCTGCCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102311 GCTTGCCAGTGTACCTGCTGGTGGGGCTGTAGCCGTCTCTGCTGCCCCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCTCTGCAGCCCCTGCTGCTGGTTCTGCCCCTGCTGCAG         CA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102361 GCTCTGCAGCCCCTGCTGCTGGTTCTGCCCCTGCTGCAGGTA...CAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGGAGAAGAAAGATGAGAAGAAGGAGGAGTCTGAAGAGTCAGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102528 GAGGAGAAGAAAGATGAGAAGAAGGAGGAGTCTGAAGAGTCAGATGATGA

    350     .    :    .    :
    324 CATGGGATTTGGCCTTTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||
 102578 CATGGGATTTGGCCTTTTTGAT