seq1 = pF1KE5180.tfa, 456 bp
seq2 = pF1KE5180/gi568815579r_39333353.tfa (gi568815579r:39333353_39535895), 202543 bp

>pF1KE5180 456
>gi568815579r:39333353_39535895 (Chr19)

(complement)

1-48  (100001-100048)   97% ->
49-150  (100188-100289)   100% ->
151-390  (102135-102374)   100% ->
391-456  (102478-102543)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGTCCAAGGGCCCGCTGCAGTCGGTGCAGGTCTTCGGACGCAAG  
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||>>
 100001 ATGCCGTCCAAGGGCCCGCTGCAGTCTGTGCAGGTCTTCGGACGCAAGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49        AAGACAGCGACAGCTGTGGCGCACTGCAAACGCGGCAATGGTC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 G...CAGAAGACAGCGACAGCTGTGGCGCACTGCAAACGCGGCAATGGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCATCAAGGTGAACGGGCGGCCCCTGGAGATGATTGAGCCGCGCACGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100231 TCATCAAGGTGAACGGGCGGCCCCTGGAGATGATTGAGCCGCGCACGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAGTACAAG         CTGCTGGAGCCAGTTCTGCTTCTCGGCAAGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 100281 CAGTACAAGGTG...TAGCTGCTGGAGCCAGTTCTGCTTCTCGGCAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCGATTTGCTGGTGTAGACATCCGTGTCCGTGTAAAGGGTGGTGGTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102167 GCGATTTGCTGGTGTAGACATCCGTGTCCGTGTAAAGGGTGGTGGTCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGGCCCAGATTTATGGTGAGTCCCAGGAACTGGGCGCATGGAGGAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102217 TGGCCCAGATTTATGGTGAGTCCCAGGAACTGGGCGCATGGAGGAGGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCTGGGAGGGAGGCCTTCACAGCGCTCCTGTACCCTTTAATTGTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102267 CTCTGGGAGGGAGGCCTTCACAGCGCTCCTGTACCCTTTAATTGTGTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTCTCACAGCTATCCGTCAGTCCATCTCCAAAGCCCTGGTGGCCTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102317 TTTCTCACAGCTATCCGTCAGTCCATCTCCAAAGCCCTGGTGGCCTATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCAGAAAT         ATGTGGATGAGGCTTCCAAGAAGGAGATCAAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 102367 CCAGAAATGTG...CAGATGTGGATGAGGCTTCCAAGAAGGAGATCAAAG

    450     .    :    .    :    .    :
    424 ACATCCTCATCCAGTATGACCGGACCCTGCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 102511 ACATCCTCATCCAGTATGACCGGACCCTGCTGG