seq1 = pF1KE5168.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KE5168/gi568815593r_178049716.tfa (gi568815593r:178049716_178253817), 204102 bp

>pF1KE5168 459
>gi568815593r:178049716_178253817 (Chr5)

(complement)

1-160  (100001-100160)   100% ->
161-230  (100258-100327)   100% ->
231-336  (102825-102930)   100% ->
337-459  (103980-104102)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCAAAATAAAGGCAGATCCCGACGGGCCCGAGGCTCAGGCGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCAAAATAAAGGCAGATCCCGACGGGCCCGAGGCTCAGGCGGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGTTCCGGGGAGCGCACCTACCAGGAGCTGCTGGTCAACCAGAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTGTTCCGGGGAGCGCACCTACCAGGAGCTGCTGGTCAACCAGAACCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCGCAGCCCCTGGCTTCTCGCCGCCTCACGCGGAAGCTCTACAAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGCGCAGCCCCTGGCTTCTCGCCGCCTCACGCGGAAGCTCTACAAATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCAAGAAAG         CGGTGAAGCAGAAGCAGATTCGGCGCGGGGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCAAGAAAGGTG...CAGCGGTGAAGCAGAAGCAGATTCGGCGCGGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAAGAGGTTCAGAAATTTGTCAACAAAGGAGAAAAAGG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100289 GAAAGAGGTTCAGAAATTTGTCAACAAAGGAGAAAAAGGGTA...CAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCATGGTTTTGGCAGGAGACACACTGCCCATTGAGGTATACTGCCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102827 TCATGGTTTTGGCAGGAGACACACTGCCCATTGAGGTATACTGCCATCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCAGTCATGTGTGAGGACCGAAATTTGCCCTATGTCTATATCCCCTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102877 CCAGTCATGTGTGAGGACCGAAATTTGCCCTATGTCTATATCCCCTCTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GACG         GACCTGGGTGCAGCCGCAGGCTCCAAGCGCCCCACCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102927 GACGGTA...TAGGACCTGGGTGCAGCCGCAGGCTCCAAGCGCCCCACCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGTGATAATGGTCAAGCCCCATGAGGAGTACCAGGAGGCTTACGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104017 GTGTGATAATGGTCAAGCCCCATGAGGAGTACCAGGAGGCTTACGATGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    424 TGCCTGGAGGAGGTGCAGTCCCTGCCCCTACCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104067 TGCCTGGAGGAGGTGCAGTCCCTGCCCCTACCCCTA