seq1 = pF1KE5165.tfa, 420 bp
seq2 = pF1KE5165/gi568815591f_100606831.tfa (gi568815591f:100606831_100807250), 200420 bp

>pF1KE5165 420
>gi568815591f:100606831_100807250 (Chr7)

1-420  (100001-100420)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGAAAACCGAGAGCCCCGCGGTGCTGTGGAGGCTGAACTGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGAAAACCGAGAGCCCCGCGGTGCTGTGGAGGCTGAACTGGATCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGGAATACACCCTTAGGAAAAGGCTTCCCAGCCGCCTGCCCCGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGGAATACACCCTTAGGAAAAGGCTTCCCAGCCGCCTGCCCCGGAGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCAATGACATTTATGTCAACATGAAGACGGACTTTAAGGCCCAGCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCAATGACATTTATGTCAACATGAAGACGGACTTTAAGGCCCAGCTGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTGCCAGAAGCTGCTGGACGGAGGGGCCCGGGGTCAGAACGCGTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCTGCCAGAAGCTGCTGGACGGAGGGGCCCGGGGTCAGAACGCGTGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGATCTACATTCACGGCTTGGGCCTGGCCATCAACCGCGCCATCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGATCTACATTCACGGCTTGGGCCTGGCCATCAACCGCGCCATCAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGCGCTGCAGCTGCAGGCGGGCAGCTTCGGGTCCTTGCAGGTGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGCGCTGCAGCTGCAGGCGGGCAGCTTCGGGTCCTTGCAGGTGGCTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATACCTCCACCGTGGAGCTTGTTGATGAGCTGGAGCCAGAGACCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATACCTCCACCGTGGAGCTTGTTGATGAGCTGGAGCCAGAGACCGACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACGGGAGCCACTGACTCGGATCCGCAACAACTCAGCCATCCACATCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACGGGAGCCACTGACTCGGATCCGCAACAACTCAGCCATCCACATCCGAG

    400     .    :    .    :
    401 TCTTCAGGGTCACACCCAAG
        ||||||||||||||||||||
 100401 TCTTCAGGGTCACACCCAAG