seq1 = pF1KE5163.tfa, 432 bp
seq2 = pF1KE5163/gi568815592f_125120075.tfa (gi568815592f:125120075_125353755), 233681 bp

>pF1KE5163 432
>gi568815592f:125120075_125353755 (Chr6)

1-19  (33878-33896)   100% ->
20-135  (100004-100119)   100% ->
136-284  (109044-109192)   100% ->
285-386  (128208-128309)   100% ->
387-432  (133643-133685)   91%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCGCAGGCACAAG         GTTTGTTGGAGACTGAACCGTT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  33878 ATGGAGGCGCAGGCACAAGGTG...AAGGTTTGTTGGAGACTGAACCGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCAAGGAACAGACGAAGATGCAGTAGCCAGTGCTGACTTCTCTAGCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100026 GCAAGGAACAGACGAAGATGCAGTAGCCAGTGCTGACTTCTCTAGCATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCTCTGAGGAGGAAAAGGAAGAGTTAAAAGCAGAGTTAGTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100076 TCTCTGAGGAGGAAAAGGAAGAGTTAAAAGCAGAGTTAGTTCAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    136    CTAGAAGACGAAATTACAACACTACGACAAGTTTTGTCAGCGAAAGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109041 TAGCTAGAAGACGAAATTACAACACTACGACAAGTTTTGTCAGCGAAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAGGCATCTAGTTGAGATAAAACAAAAACTCGGCATGAACCTGATGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109091 AAGGCATCTAGTTGAGATAAAACAAAAACTCGGCATGAACCTGATGAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AATTAAAACAGAACTTCAGCAAAAGCTGGCATGACATGCAGACTACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109141 AATTAAAACAGAACTTCAGCAAAAGCTGGCATGACATGCAGACTACCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GC         CTACAAGAAAACACATGAAACCCTGAGTCACGCAGGGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109191 GCGTA...TAGCTACAAGAAAACACATGAAACCCTGAGTCACGCAGGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAGGCAACTGCAGCTTTCAGCAACGTTGGAACGGCCATCAGCAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128247 AAAGGCAACTGCAGCTTTCAGCAACGTTGGAACGGCCATCAGCAAGAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCGGAGACATGAG         TTACTCCATTCGCCATTCCATAAGTATG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 128297 TCGGAGACATGAGGTA...AAGTTACTCCATTCGCCATTCCATAAGTATG

    450     .    :    .
    415 CCTGCTATGAGACGAAAG
        |||||||||||--| ||-
 133671 CCTGCTATGAG  GTAA