seq1 = pF1KE5162.tfa, 336 bp
seq2 = pF1KE5162/gi568815579f_45399964.tfa (gi568815579f:45399964_45602082), 202119 bp

>pF1KE5162 336
>gi568815579f:45399964_45602082 (Chr19)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-209  (100493-100598)   100% ->
210-270  (100687-100747)   100% ->
271-336  (102054-102119)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCTGCATCCTGGTCTGCTTCCCTGGGGCCCCTAGGCCTTCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCTGCATCCTGGTCTGCTTCCCTGGGGCCCCTAGGCCTTCTGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGATCAGGAGGGAGCTAGCACTGGACGCAGCCCTGGGCTGCAGAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGATCAGGAGGGAGCTAGCACTGGACGCAGCCCTGGGCTGCAGAATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTG         AACTGTGTGCCTCTGCTCAGAAGCCCCCCAGCCTGAAC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGGTG...CAGAACTGTGTGCCTCTGCTCAGAAGCCCCCCAGCCTGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAGTTTTCAGGACTCTGGCCTCAGAGGACATCCCAGATTTACCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100531 ACAGTTTTCAGGACTCTGGCCTCAGAGGACATCCCAGATTTACCTCCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGAGGGCTGGACTGCAA         GGCCACTGTCATTGCTGAAGTTT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100581 GGGAGGGCTGGACTGCAAGTG...CAGGGCCACTGTCATTGCTGAAGTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATTCTCAGATCTGCCAGGTCTCAGAAGAGTGCGGAGAG         AAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100710 ATTCTCAGATCTGCCAGGTCTCAGAAGAGTGCGGAGAGGTA...CAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GGGCAGGATGGGGCTGGGAAGTCCAACCCCACGCATTTGGGCTCAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102057 GGGCAGGATGGGGCTGGGAAGTCCAACCCCACGCATTTGGGCTCAGCCTT

    350     .    :
    324 GGACATGGAGGCC
        |||||||||||||
 102107 GGACATGGAGGCC