seq1 = pF1KE5159.tfa, 480 bp
seq2 = pF1KE5159/gi568815584f_20791687.tfa (gi568815584f:20791687_20992166), 200480 bp

>pF1KE5159 480
>gi568815584f:20791687_20992166 (Chr14)

1-480  (100001-100480)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTCCAAAACTGTTCACTTCCCAAATTTGTCTGCTTCTTCTGTTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTTATGGGTGTGGAGGGCTCACTCCATGCCAGACCCCCACAGTTTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTTATGGGTGTGGAGGGCTCACTCCATGCCAGACCCCCACAGTTTACGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGGCTCAGTGGTTTGCCATCCAGCACATCAGTCTGAACCCCCCTCGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGGCTCAGTGGTTTGCCATCCAGCACATCAGTCTGAACCCCCCTCGATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCATTGCAATGCGGGCAATTAACAATTATCGATGGCGTTGCAAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCATTGCAATGCGGGCAATTAACAATTATCGATGGCGTTGCAAAAACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAATACTTTTCTTCGTACAACTTTTGCTAATGTAGTTAATGTTTGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAATACTTTTCTTCGTACAACTTTTGCTAATGTAGTTAATGTTTGTGGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCAAAGTATACGCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAACAATTGTCATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCAAAGTATACGCTGCCCTCATAACAGAACTCTCAACAATTGTCATCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGTAGATTCCGGGTGCCTTTACTCCACTGTGACCTCATAAATCCAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGTAGATTCCGGGTGCCTTTACTCCACTGTGACCTCATAAATCCAGGTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACAGAATATTTCAAACTGCAGGTATGCAGACAGACCAGGAAGGAGGTTCT
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ACAGAATATTTCAAACTGCACGTATGCAGACAGACCAGGAAGGAGGTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGTAGTTGCATGTGACAACAGAGATCCACGGGATTCTCCACGGTATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGTAGTTGCATGTGACAACAGAGATCCACGGGATTCTCCACGGTATCCT

    450     .    :    .    :    .    :
    451 GTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGTTCCAGTTCACCTGGATACCACCATC