seq1 = pF1KE5152.tfa, 261 bp
seq2 = pF1KE5152/gi568815579f_35019377.tfa (gi568815579f:35019377_35223309), 203933 bp

>pF1KE5152 261
>gi568815579f:35019377_35223309 (Chr19)

1-40  (100001-100040)   100% ->
41-73  (101702-101734)   96% ->
74-97  (101846-101869)   100% ->
98-172  (103389-103463)   100% ->
173-209  (103542-103578)   100% ->
210-247  (103895-103932)   100% ->
248-261  (104065-104078)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGAAGGTGACCCTGGGCCTGCTTGTGTTCCTGGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100001 ATGCAGAAGGTGACCCTGGGCCTGCTTGTGTTCCTGGCAGGTG...TAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTTTCCTGTCCTGGATGCCAATGACCTAGAAG         ATAAAAACA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 101703 CTTTCCTGTCCTGGACGCCAATGACCTAGAAGGTG...CAGATAAAAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 GTCCTTTCTACTATG         ACTGGCACAGCCTCCAGGTTGGCGGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101855 GTCCTTTCTACTATGGTG...TAGACTGGCACAGCCTCCAGGTTGGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    124 CTCATCTGCGCTGGGGTTCTGTGCGCCATGGGCATCATCATCGTCATGA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 103415 CTCATCTGCGCTGGGGTTCTGTGCGCCATGGGCATCATCATCGTCATGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    173         GTGCAAAATGCAAATGCAAGTTTGGCCAGAAGTCCGG     
        >>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 103465 TG...CAGGTGCAAAATGCAAATGCAAGTTTGGCCAGAAGTCCGGGTA..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    210     TCACCATCCAGGGGAGACTCCACCTCTCATCACCCCAG        
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 103584 .TAGTCACCATCCAGGGGAGACTCCACCTCTCATCACCCCAGGTA...CA

    300     .    :    .
    248  GCTCAGCCCAAAGC
        >||||||||||||||
 104064 GGCTCAGCCCAAAGC