seq1 = pF1KE5150.tfa, 258 bp
seq2 = pF1KE5150/gi568815586f_95761167.tfa (gi568815586f:95761167_95966068), 204902 bp

>pF1KE5150 258
>gi568815586f:95761167_95966068 (Chr12)

1-129  (100000-100127)   99% ->
130-194  (104158-104222)   100% ->
195-258  (104839-104902)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTTACCCCTCAATCCCAAACCTTTCCTCAATGGACTAACAGGAAA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GAGTTTACCCCTCAATCCCAAACCTTTCCTCAATGGACTAACAGGAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCAGTGATGGTGAAACTTAAGTGGGGAATGGAGTACAAGGGCTATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GCCAGTGATGGTGAAACTTAAGTGGGGAATGGAGTACAAGGGCTATCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATCTGTAGATGGCTACATGAACATGCAG         CTTGCAAATACA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100099 TATCTGTAGATGGCTACATGAACATGCAGGTA...AAGCTTGCAAATACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAAGAATACATAGATGGAGCTTTGTCTGGACATCTGGGTGAAGTTTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104170 GAAGAATACATAGATGGAGCTTTGTCTGGACATCTGGGTGAAGTTTTAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAG         GTGTAATAATGTCCTTTATATCAGAGGTGTGGAAGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104220 AAGGTA...CAGGTGTAATAATGTCCTTTATATCAGAGGTGTGGAAGAAG

    250     .    :    .    :    .
    233 AGGAAGAAGATGGGGAAATGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||
 104877 AGGAAGAAGATGGGGAAATGAGAGAA