seq1 = pF1KE5145.tfa, 300 bp
seq2 = pF1KE5145/gi568815597f_156142232.tfa (gi568815597f:156142232_156343159), 200928 bp

>pF1KE5145 300
>gi568815597f:156142232_156343159 (Chr1)

1-64  (100001-100064)   100% ->
65-103  (100322-100360)   100% ->
104-173  (100531-100600)   100% ->
174-300  (100802-100928)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGAGCCCTCACACTCCTCGCCCTATTGGCCCTGGCCGCACTTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGAGCCCTCACACTCCTCGCCCTATTGGCCCTGGCCGCACTTTGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCTGGCCAGGCAG         GTGCGAAGCCCAGCGGTGCAGAGTCCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCTGGCCAGGCAGGTG...CAGGTGCGAAGCCCAGCGGTGCAGAGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAAAGGTGCAG         CCTTTGTGTCCAAGCAGGAGGGCAGCGAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100349 GCAAAGGTGCAGGTA...CAGCCTTTGTGTCCAAGCAGGAGGGCAGCGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTAGTGAAGAGACCCAGGCGCTACCTGTATCAATGGCTGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100560 GTAGTGAAGAGACCCAGGCGCTACCTGTATCAATGGCTGGGGTG...CAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 AGCCCCAGTCCCCTACCCGGATCCCCTGGAGCCCAGGAGGGAGGTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100802 AGCCCCAGTCCCCTACCCGGATCCCCTGGAGCCCAGGAGGGAGGTGTGTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGCTCAATCCGGACTGTGACGAGTTGGCTGACCACATCGGCTTTCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100852 AGCTCAATCCGGACTGTGACGAGTTGGCTGACCACATCGGCTTTCAGGAG

    300     .    :    .    :    .
    274 GCCTATCGGCGCTTCTACGGCCCGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||
 100902 GCCTATCGGCGCTTCTACGGCCCGGTC