seq1 = pF1KE5136.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KE5136/gi568815592f_25920490.tfa (gi568815592f:25920490_26120897), 200408 bp

>pF1KE5136 408
>gi568815592f:25920490_26120897 (Chr6)

1-408  (100001-100408)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGCACTAAGCAAACTGCTCGGAAGTCTACTGGTGGCAAGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGCACTAAGCAAACTGCTCGGAAGTCTACTGGTGGCAAGGCGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACGCAAACAGTTGGCCACTAAGGCAGCCCGCAAAAGCGCTCCGGCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACGCAAACAGTTGGCCACTAAGGCAGCCCGCAAAAGCGCTCCGGCCACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGGCGTGAAAAAGCCCCACCGCTACCGGCCGGGCACCGTGGCTCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGGCGTGAAAAAGCCCCACCGCTACCGGCCGGGCACCGTGGCTCTGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGATCCGCCGTTATCAGAAGTCCACTGAACTGCTTATTCGTAAACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGATCCGCCGTTATCAGAAGTCCACTGAACTGCTTATTCGTAAACTACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCCAGCGCCTGGTGCGCGAGATTGCGCAGGACTTTAAAACAGACCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCCAGCGCCTGGTGCGCGAGATTGCGCAGGACTTTAAAACAGACCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTTTCCAGAGCTCCGCTGTGATGGCTCTGCAGGAGGCGTGCGAGGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTTTCCAGAGCTCCGCTGTGATGGCTCTGCAGGAGGCGTGCGAGGCCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGGTAGGGCTATTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCACGCCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGGTAGGGCTATTTGAGGACACTAACCTGTGCGCCATCCACGCCAAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGTCACTATCATGCCCAAGGACATCCAGCTCGCCCGCCGCATCCGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGTCACTATCATGCCCAAGGACATCCAGCTCGCCCGCCGCATCCGCGGAG

    400     .
    401 AGAGGGCG
        ||||||||
 100401 AGAGGGCG