seq1 = pF1KE5133.tfa, 498 bp
seq2 = pF1KE5133/gi568815586f_123153675.tfa (gi568815586f:123153675_123357028), 203354 bp

>pF1KE5133 498
>gi568815586f:123153675_123357028 (Chr12)

1-282  (100001-100282)   100% ->
283-498  (103139-103354)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCACCGTGGGTTTATTTCATTTTCCTACACCACTGACCCGAATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCACCGTGGGTTTATTTCATTTTCCTACACCACTGACCCGAATATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGGCGCCATGGGGACTCCGGCTTTGGGAGAAGCTGACGTTGTTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCGGCGCCATGGGGACTCCGGCTTTGGGAGAAGCTGACGTTGTTATCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGAATAGCTGTCACTCCGGTCCAGATGGCAGGCAAGAAGGACTACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGAATAGCTGTCACTCCGGTCCAGATGGCAGGCAAGAAGGACTACCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCACTGCTTTCCTTGGATGAGAATGAACTCGAAGAGCAGTTTGTGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCACTGCTTTCCTTGGATGAGAATGAACTCGAAGAGCAGTTTGTGAAAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACACGGTCCAGGGGGCCAGGCAACCAACAAAACCAGCAACTGCGTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACACGGTCCAGGGGGCCAGGCAACCAACAAAACCAGCAACTGCGTGGTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGAAGCACATCCCCTCAGGCATCGTTGTAAAG         TGCCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100251 TGAAGCACATCCCCTCAGGCATCGTTGTAAAGGTA...CAGTGCCATCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACAAGATCAGTTGATCAGAACAGAAAGCTAGCTCGGAAAATCCTACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103148 ACAAGATCAGTTGATCAGAACAGAAAGCTAGCTCGGAAAATCCTACAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAAGTAGATGTTTTCTACAATGGTGAAAACAGTCCTGTTCACAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103198 GAAAGTAGATGTTTTCTACAATGGTGAAAACAGTCCTGTTCACAAAGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AACGAGAAGCGGCGAAGAAAAAACAAGAAAGGAAAAAAAGAGCAAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103248 AACGAGAAGCGGCGAAGAAAAAACAAGAAAGGAAAAAAAGAGCAAAGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCCTGGAAAAAAAGAAGCTACTTAAAGAACTGTGGGAGTCAAGTAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103298 ACCCTGGAAAAAAAGAAGCTACTTAAAGAACTGTGGGAGTCAAGTAAAAA

    500     .
    492 GGTCCAC
        |||||||
 103348 GGTCCAC