seq1 = pF1KE5132.tfa, 330 bp
seq2 = pF1KE5132/gi568815586r_54544716.tfa (gi568815586r:54544716_54748303), 203588 bp

>pF1KE5132 330
>gi568815586r:54544716_54748303 (Chr12)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-97  (101145-101183)   100% ->
98-199  (102597-102698)   100% ->
200-289  (103042-103131)   100% ->
290-330  (103548-103588)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTTCATGACTCTCCTCTTCCTGACAGCTCTGGCAGGAGCCCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTTCATGACTCTCCTCTTCCTGACAGCTCTGGCAGGAGCCCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGTGCCT         ATGATCCAGAGGCCGCCTCTGCCCCAGGATCGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGTGCCTGTG...CAGATGATCCAGAGGCCGCCTCTGCCCCAGGATCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGAACC         CTTGCCATGAAGCATCAGCAGCTCAAAAGGAAAAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101178 GGAACCGTG...CAGCTTGCCATGAAGCATCAGCAGCTCAAAAGGAAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCAGGTGAAGACCCAGGGTTAGCCAGACAGGCACCAAAGCCAAGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102632 GCAGGTGAAGACCCAGGGTTAGCCAGACAGGCACCAAAGCCAAGGAAGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAGATCCAGCCTTCTGG         AAAAAGGCCTAGACGGAGCAAAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102682 GAGATCCAGCCTTCTGGGTA...TAGAAAAAGGCCTAGACGGAGCAAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AAGCTGTGGGGGGACTCGGAAAACTAGGAAAAGATGCAGTCGAAGATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103066 AAGCTGTGGGGGGACTCGGAAAACTAGGAAAAGATGCAGTCGAAGATCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAAAGCGTGGGTAAAG         GAGCCGTCCATGACGTTAAAGACGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 103116 GAAAGCGTGGGTAAAGGTG...TAGGAGCCGTCCATGACGTTAAAGACGT

    350     .    :    .
    315 CCTTGACTCAGTACTA
        ||||||||||||||||
 103573 CCTTGACTCAGTACTA