seq1 = pF1KE5131.tfa, 420 bp
seq2 = pF1KE5131/gi568815596r_24690414.tfa (gi568815596r:24690414_24893377), 202964 bp

>pF1KE5131 420
>gi568815596r:24690414_24893377 (Chr2)

(complement)

1-252  (100001-100252)   100% ->
253-420  (102797-102964)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACCGGGGAGTAGGTCCGGCCTTTCGGGTGGTCAGGAAGATGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACCGGGGAGTAGGTCCGGCCTTTCGGGTGGTCAGGAAGATGGCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGGGGCGGAGCCGCAGGTCCTGGTACAATACTTGGTGTTACGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTGGGGCGGAGCCGCAGGTCCTGGTACAATACTTGGTGTTACGAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATCTATCACAAGCTCCGTTCTCCTGGCCGGCGGGCGCACTGGTAGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATCTATCACAAGCTCCGTTCTCCTGGCCGGCGGGCGCACTGGTAGCGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTTGTCACGCGGCCACCGCGGCCTTGCACACTCACCGCGACCACCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTTGTCACGCGGCCACCGCGGCCTTGCACACTCACCGCGACCACCCGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CACAGCCGCTTACCTCCAAGAGCTGGGGCGCATGCGCAAAGTGGTCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CACAGCCGCTTACCTCCAAGAGCTGGGGCGCATGCGCAAAGTGGTCCTCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AG         GCCCCAGATGAGACCACCCTAAAGGAGCTGGCCGAGACC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGTG...TAGGCCCCAGATGAGACCACCCTAAAGGAGCTGGCCGAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTGCAACAGAAGAACATTGACCACATGCTGTGGCTTGAGCAACCAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102836 CTGCAACAGAAGAACATTGACCACATGCTGTGGCTTGAGCAACCAGAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TATCGCCACTTGTATTGCTCTCCGGCCCTACCCCAAGGAAGAAGTGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102886 TATCGCCACTTGTATTGCTCTCCGGCCCTACCCCAAGGAAGAAGTGGGCC

    400     .    :    .    :    .
    392 AGTATTTGAAGAAGTTCCGATTGTTCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||
 102936 AGTATTTGAAGAAGTTCCGATTGTTCAAG