seq1 = pF1KE5130.tfa, 450 bp
seq2 = pF1KE5130/gi568815583f_84503928.tfa (gi568815583f:84503928_84706572), 202645 bp

>pF1KE5130 450
>gi568815583f:84503928_84706572 (Chr15)

1-406  (100001-100406)   100% ->
407-450  (102602-102645)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCTGCAGACATCCCGAGAGTGACCACTCCGCTGAGCTCCTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCTGCAGACATCCCGAGAGTGACCACTCCGCTGAGCTCCTTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGGTGCCTCAAGAGGAAGATAGACAGGAGGAGGAGGTCACCACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGGTGCCTCAAGAGGAAGATAGACAGGAGGAGGAGGTCACCACCATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTGGAGGATGACTCCTGGGTGCAAGAAGCTGTGCTGCAGGAGGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTGGAGGATGACTCCTGGGTGCAAGAAGCTGTGCTGCAGGAGGATGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGAGTCTGAGCCCTTTCCCCAGAGTGCTGGCAAGGGCGGCCCCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGAGTCTGAGCCCTTTCCCCAGAGTGCTGGCAAGGGCGGCCCCCAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGGTGACCAGGGGACCACAGGGTGCACTCGGCCGCCTCCGAGAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGGTGACCAGGGGACCACAGGGTGCACTCGGCCGCCTCCGAGAGCTCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCGGCGCTGGCTGAGACCAGAGGTACACACCAAGGAGCAGATGTTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCGGCGCTGGCTGAGACCAGAGGTACACACCAAGGAGCAGATGTTAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGCTGCCAAAGGAAATTCAGGCTTGGCTGCAAGAGCATCGGCCTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGCTGCCAAAGGAAATTCAGGCTTGGCTGCAAGAGCATCGGCCTGAAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGTGAGGAGGCAGCGGCCCTGGTGGAAGACTTGACCCAGACCCTTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGTGAGGAGGCAGCGGCCCTGGTGGAAGACTTGACCCAGACCCTTCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACAGTG         CTGTAGCTGTCTTTGCTTCCCTTCCGGTGGAGGTG
        ||||||>>>...>>>||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100401 ACAGTGGTG...CAGCTGTAGCTGTCGTTGCTTCCCTTCCGGTGGAGGTG

    450     .
    442 ACCAGTTTG
        |||||||||
 102637 ACCAGTTTG