seq1 = pF1KE5128.tfa, 384 bp
seq2 = pF1KE5128/gi568815576r_41574936.tfa (gi568815576r:41574936_41780365), 205430 bp

>pF1KE5128 384
>gi568815576r:41574936_41780365 (Chr22)

(complement)

1-124  (99998-100122)   99% ->
125-384  (105171-105430)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 AT GACTGAGGCTGATGTGAATCCAAAGGCCTATCCCCTTGCCGATGCCC
        ||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99998 ATAGACTGAGGCTGATGTGAATCCAAAGGCCTATCCCCTTGCCGATGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 ACCTCACCAAGAAGCTACTGGACCTCGTTCAGCAGTCATGTAACTATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 ACCTCACCAAGAAGCTACTGGACCTCGTTCAGCAGTCATGTAACTATAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100 CAGCTTCGGAAAGGAGCCAATGAGG         CCACCAAAACCCTCAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 100098 CAGCTTCGGAAAGGAGCCAATGAGGGTA...CAGCCACCAAAACCCTCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 CAGGGGCATCTCTGAGTTCATCGTGATGGCTGCAGACGCCGAGCCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105187 CAGGGGCATCTCTGAGTTCATCGTGATGGCTGCAGACGCCGAGCCACTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    191 AGATCATTCTGCACCTGCCGCTGCTGTGTGAAGACAAGAATGTGCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105237 AGATCATTCTGCACCTGCCGCTGCTGTGTGAAGACAAGAATGTGCCCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    241 GTGTTTGTGCGCTCCAAGCAGGCCCTGGGGAGAGCCTGTGGGGTCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105287 GTGTTTGTGCGCTCCAAGCAGGCCCTGGGGAGAGCCTGTGGGGTCTCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    291 GCCTGTCATCGCCTGTTCTGTCACCATCAAAGAAGGCTCGCAGCTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105337 GCCTGTCATCGCCTGTTCTGTCACCATCAAAGAAGGCTCGCAGCTGAAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :
    341 AGCAGATCCAATCCATTCAGCAGTCCATTGAAAGGCTCTTAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105387 AGCAGATCCAATCCATTCAGCAGTCCATTGAAAGGCTCTTAGTC