seq1 = pF1KE5123.tfa, 459 bp
seq2 = pF1KE5123/gi568815595r_170793363.tfa (gi568815595r:170793363_171007806), 214444 bp

>pF1KE5123 459
>gi568815595r:170793363_171007806 (Chr3)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-270  (100714-100818)   100% ->
271-402  (113384-113515)   100% ->
403-459  (114388-114444)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGACGAAATTGATTTCACTACTGGAGATGCCGGGGCTTCCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGACGAAATTGATTTCACTACTGGAGATGCCGGGGCTTCCAGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTACCCTATGCAGTGCTCGGCCTTGCGCAAAAACGGCTTCGTGGTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTACCCTATGCAGTGCTCGGCCTTGCGCAAAAACGGCTTCGTGGTGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGGACGACCATGCAAAATAGTGGAGATGTCAACTTCCAAAACTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGGACGACCATGCAAAATAGTGGAGATGTCAACTTCCAAAACTGGAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATGGTCATGCCAAG         GTTCACCTTGTTGGAATTGATATTTT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATGGTCATGCCAAGGTA...TAGGTTCACCTTGTTGGAATTGATATTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACGGGCAAAAAATATGAAGATATTTGTCCTTCTACTCACAACATGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100740 CACGGGCAAAAAATATGAAGATATTTGTCCTTCTACTCACAACATGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCCAAATATTAAGAGAAATGATTATCAA         CTGATATGCATT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100790 TTCCAAATATTAAGAGAAATGATTATCAAGTA...TAGCTGATATGCATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAAGATGGTTACCTTTCCCTGCTGACAGAAACTGGTGAAGTTCGTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113396 CAAGATGGTTACCTTTCCCTGCTGACAGAAACTGGTGAAGTTCGTGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTTAAACTGCCAGAAGGTGAACTAGGCAAAGAAATAGAGGGAAAATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113446 TCTTAAACTGCCAGAAGGTGAACTAGGCAAAGAAATAGAGGGAAAATACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATGCAGGTGAAGATGTACAG         GTGTCTGTCATGTGTGCAATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 113496 ATGCAGGTGAAGATGTACAGGTA...TAGGTGTCTGTCATGTGTGCAATG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    424 AGTGAAGAATATGCTGTAGCCATAAAACCCTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114409 AGTGAAGAATATGCTGTAGCCATAAAACCCTGCAAA