seq1 = pF1KE5116.tfa, 441 bp
seq2 = pF1KE5116/gi568815587r_5168472.tfa (gi568815587r:5168472_5369890), 201419 bp

>pF1KE5116 441
>gi568815587r:5168472_5369890 (Chr11)

(complement)

1-92  (100001-100092)   100% ->
93-315  (100215-100437)   100% ->
316-441  (101294-101419)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCATTTTACTGCTGAGGAGAAGGCTGCCGTCACTAGCCTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGCATTTTACTGCTGAGGAGAAGGCTGCCGTCACTAGCCTGTGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAGATGAATGTGGAAGAGGCTGGAGGTGAAGCCTTGGGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100051 CAAGATGAATGTGGAAGAGGCTGGAGGTGAAGCCTTGGGCAGGTA...TA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     93  ACTCCTCGTTGTTTACCCCTGGACCCAGAGATTTTTTGACAGCTTTGGA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100214 GACTCCTCGTTGTTTACCCCTGGACCCAGAGATTTTTTGACAGCTTTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACCTGTCGTCTCCCTCTGCCATCCTGGGCAACCCCAAGGTCAAGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100264 AACCTGTCGTCTCCCTCTGCCATCCTGGGCAACCCCAAGGTCAAGGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGGCAAGAAGGTGCTGACTTCCTTTGGAGATGCTATTAAAAACATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100314 TGGCAAGAAGGTGCTGACTTCCTTTGGAGATGCTATTAAAAACATGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCTCAAGCCCGCCTTTGCTAAGCTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100364 ACCTCAAGCCCGCCTTTGCTAAGCTGAGTGAGCTGCACTGTGACAAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATGTGGATCCTGAGAACTTCAAG         CTCCTGGGTAACGTGAT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100414 CATGTGGATCCTGAGAACTTCAAGGTG...CAGCTCCTGGGTAACGTGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGTGATTATTCTGGCTACTCACTTTGGCAAGGAGTTCACCCCTGAAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101311 GGTGATTATTCTGGCTACTCACTTTGGCAAGGAGTTCACCCCTGAAGTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGCTGCCTGGCAGAAGCTGGTGTCTGCTGTCGCCATTGCCCTGGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101361 AGGCTGCCTGGCAGAAGCTGGTGTCTGCTGTCGCCATTGCCCTGGCCCAT

    450     .
    433 AAGTACCAC
        |||||||||
 101411 AAGTACCAC