seq1 = pF1KE5114.tfa, 354 bp
seq2 = pF1KE5114/gi568815583f_82889019.tfa (gi568815583f:82889019_83090064), 201046 bp

>pF1KE5114 354
>gi568815583f:82889019_83090064 (Chr15)

1-170  (100001-100170)   100% ->
171-354  (100863-101046)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGACACTGCCGAAGCTGTTCCAAAGTTTGAAGAGATGTTTGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTGACACTGCCGAAGCTGTTCCAAAGTTTGAAGAGATGTTTGCTAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TAGATTCACAGAAAATGACAAGGAGTATCAGGAATACCTGAAACGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TAGATTCACAGAAAATGACAAGGAGTATCAGGAATACCTGAAACGCCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGAGTCTCCTCCAATTGTTGAGGAATGGAATAGCAGAGCTGGTGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGAGTCTCCTCCAATTGTTGAGGAATGGAATAGCAGAGCTGGTGGGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAAAGAAACAGAGGCAATCG         GTTGCAAGACAACAGACAGTT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100151 CAAAGAAACAGAGGCAATCGGTG...TAGGTTGCAAGACAACAGACAGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGAGGCAGGGACAACAGATGGGGGTGGCCAAGTGACAATCGATCCAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100884 CAGAGGCAGGGACAACAGATGGGGGTGGCCAAGTGACAATCGATCCAATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGTGGCATGGACGATCCTGGGGTAACAACTACCCGCAACACAGACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100934 AGTGGCATGGACGATCCTGGGGTAACAACTACCCGCAACACAGACAAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTTACTATCCCCAGCAATATGGACATTATGGTTACAACCAGCGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100984 CCTTACTATCCCCAGCAATATGGACATTATGGTTACAACCAGCGGCCTCC

    350     .    :
    342 TTACGGTTACTAC
        |||||||||||||
 101034 TTACGGTTACTAC