seq1 = pF1KE5109.tfa, 477 bp
seq2 = pF1KE5109/gi568815597r_25194167.tfa (gi568815597r:25194167_25394643), 200477 bp

>pF1KE5109 477
>gi568815597r:25194167_25394643 (Chr1)

(complement)

1-477  (100001-100477)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGTTCTCTGGAGGCTGAGTGCCGTTTGCGGTGCCCTAGGAGGCCG
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100001 ATGGCGGTTCCCTGGAGGCTGAGTGCCGTTTGCGGTGCCCAAGGAGGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCTCTGTTGCTTCGAACTCCAGTGGTCAGACCTGCTCATATCTCAGCAT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCTCTGTTGCTGCGAACTCCAGTGGTCAGACCTGCTCATATCTCAGCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCTTCAGGACCGACCTATCCCAGAATGGTGTGGAGTGCAGCACATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCTTCAGGACCGACCTATCCCAGAATGGTGTGGAGTGCAGCACATACAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGTCACCGAGCCACCATTCTGGCTCCAAGGCTGCATCTCTCCACTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGTCACCGAGCCACCATTCTGGCTCCAAGGCTGCATCTCTCCACTGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAGCGAGAGGGTTGTCAGTGTTTTGCTCCTGGGTCTGCTTCCGGCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100201 TAGCGAGAGGGTTGTCAGTGTTTTGCTCCCGGGTCTGCTTCCGGCTGCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTTGAATCCTTGCTCTGCGATGGACTATTCCCTGGCTGCAGCCCTCACT
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTTGAATCCTTGCTCTGCGACGGACTATTCCCTGGCTGCAGCCCTCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTCATGGTCACTGGGGCCTTGGACAAGTTGTTACTGACTATGTTCATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100301 CTTCATGGTCACTGGGGCCTTGGACAAGTTGTTACTGATTATGTTCATGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGATGCCTTGCAGAAAGCTGCCAAGGCAGGGCTTTTGGCACTTTCAGCTT
        |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100351 GGATGCCTCGCAGAAAGCTGCCAAGGCAGGGCTTTTGGCATTTTCAGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TAACCTTTGCTGGGCTTTGCTATTTCAACTATCACGATGTGGGCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TAACCTTTGCTGGGCTTTGCTATTTCAACTATCACGATGTGGGCATCTGC

    450     .    :    .    :    .
    451 AAAGCTGTTGCCATGCTGTGGAAGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||
 100451 AAAGCTGTTGCCATGCTGTGGAAGCTC