seq1 = pF1KE5108.tfa, 414 bp
seq2 = pF1KE5108/gi568815597r_204090487.tfa (gi568815597r:204090487_204292876), 202390 bp

>pF1KE5108 414
>gi568815597r:204090487_204292876 (Chr1)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-414  (102080-102390)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTCACTGGTTTCTTGGCAGCTACTGCTTTTCCTCTGTGCCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTCACTGGTTTCTTGGCAGCTACTGCTTTTCCTCTGTGCCACCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGGGGAGCCATTAGAAAAGGTGGCCTCTGTGGGGAATTCTAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGGGGAGCCATTAGAAAAGGTGGCCTCTGTGGGGAATTCTAGACCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAG         GCCAGCAGCTAGAATCCCTGGGCCTCCTGGCCCCCGGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGTA...TAGGCCAGCAGCTAGAATCCCTGGGCCTCCTGGCCCCCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCAGAGCCTGCCGTGCACCGAGAGGAAGCCAGCTGCTACTGCCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102118 GAGCAGAGCCTGCCGTGCACCGAGAGGAAGCCAGCTGCTACTGCCAGGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCCGTCGGGGGACCTCGCTGTCCCCGCCCCCCGAGAGCTCCGGGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102168 GAGCCGTCGGGGGACCTCGCTGTCCCCGCCCCCCGAGAGCTCCGGGAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCAGCAGCCGGGCCTGTCCGCCCCCCACAGCCGCCAGATCCCCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102218 CCCAGCAGCCGGGCCTGTCCGCCCCCCACAGCCGCCAGATCCCCGCACCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGGGCGCGGTGCTGGTGCAGCGGGAGAAGGACCTGCCGAACTACAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102268 CAGGGCGCGGTGCTGGTGCAGCGGGAGAAGGACCTGCCGAACTACAACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAACTCCTTCGGCCTGCGCTTCGGCAAGCGGGAGGCGGCACCAGGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102318 GAACTCCTTCGGCCTGCGCTTCGGCAAGCGGGAGGCGGCACCAGGGAACC

    400     .    :    .    :
    392 ACGGCAGAAGCGCTGGGCGGGGC
        |||||||||||||||||||||||
 102368 ACGGCAGAAGCGCTGGGCGGGGC