seq1 = pF1KE5107.tfa, 309 bp
seq2 = pF1KE5107/gi568815579r_2221683.tfa (gi568815579r:2221683_2428478), 206796 bp

>pF1KE5107 309
>gi568815579r:2221683_2428478 (Chr19)

(complement)

1-97  (99995-100092)   95% ->
98-169  (104283-104354)   100% ->
170-309  (106657-106796)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGC GGATAAGGAGAAGAAGAAAAAGGAGAGCATCTTGGACTTGTCCA
           ||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99995 CCCGCAGGATAAGGAGAAGAAGAAAAAGGAGAGCATCTTGGACTTGTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     50 AGTACATCGACAAGACGATCCGGGTAAAGTTCCAGGGAGGCCGCGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100045 AGTACATCGACAAGACGATCCGGGTAAAGTTCCAGGGAGGCCGCGAAGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98        CCAGTGGAATCCTGAAGGGCTTCGACCCACTCCTCAACCTTGT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 G...AAGCCAGTGGAATCCTGAAGGGCTTCGACCCACTCCTCAACCTTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141 GCTGGACGGCACCATTGAGTACATGCGAG         ACCCTGACGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 104326 GCTGGACGGCACCATTGAGTACATGCGAGGTG...CAGACCCTGACGACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    182 AGTACAAGCTCACGGAGGACACCCGGCAGCTGGGCCTCGTGGTGTGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106669 AGTACAAGCTCACGGAGGACACCCGGCAGCTGGGCCTCGTGGTGTGCCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    232 GGCACGTCCGTGGTGCTAATCTGCCCGCAGGACGGCATGGAGGCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106719 GGCACGTCCGTGGTGCTAATCTGCCCGCAGGACGGCATGGAGGCCATCCC

    300     .    :    .    :    .
    282 CAACCCCTTCATCCAGCAGCAGGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||
 106769 CAACCCCTTCATCCAGCAGCAGGACGCC