seq1 = pF1KE5105.tfa, 345 bp
seq2 = pF1KE5105/gi568815589r_30731884.tfa (gi568815589r:30731884_30932225), 200342 bp

>pF1KE5105 345
>gi568815589r:30731884_30932225 (Chr9)

(complement)

1-345  (100001-100345)   96%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAAAGAAAAGAAGGAACAATGGTCGTGCCAAAAAGGGCCGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAAAGAAAAGAAGGAACAACGGTCGTGCCAAAAAGGGCCGCGGCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGTGCAGCCTATTCGCTGCACTAACTGTGCCCGATGCGTGCCCAAGGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100051 CGTGCAGCCTATTCGCTGCACTAACTGTGCCCGATGTGTGCCCAAGGACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCATTAAGAAATTCGTCATTCGAAACATAGTGGAGGCCGCAGCAGTC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100101 AGGCCATTAAGAAATTGGTCATTCGAAACATAGTGGAGGCCACAGCAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGGACATTTCTGAAGCGAGCGTCTTCGATGCCTATGTGCTTCCCAAGCT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100151 AGGGACATTTCTGAAGCAAGCGTCTTCGATGCCTACGTGCTTCCCAAGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTATGTGAAGCTACATTACTGTGTGAGTTGTGCAATTCACAGCAAAGTAG
        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100201 GTATGTGAAGCTGCATTACTGTGTGAGTTGTGCAATCCACAGCAAAGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAGGAATCGATCTCGTGAAGCCCGCAAGGACCGAACACCCCCACCCCGA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAGGAATCGATCTCATGAAGCCCGCAAGGACCGAACACCCCCACCCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    301 TTTAGACCTGCGGGTGCTGCCCCACGTCCCCCACCAAAGCCCATG
        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100301 TTTAGACCTGCTGGTGCTGCCCCACGTCCCCCACCAAAGCCCTTG