seq1 = pF1KE5074.tfa, 528 bp
seq2 = pF1KE5074/gi568815596f_240460685.tfa (gi568815596f:240460685_240661464), 200780 bp

>pF1KE5074 528
>gi568815596f:240460685_240661464 (Chr2)

1-393  (100001-100393)   100% ->
394-528  (100646-100780)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACCGGCAGAAGCTGGGCGCCGCGGGGCCGCCTCGCCCGTACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGACCGGCAGAAGCTGGGCGCCGCGGGGCCGCCTCGCCCGTACCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCGTTGGTGCGCGTCGCGCCCTCACTCTTCCTCGGGAGCGCGCGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCGTTGGTGCGCGTCGCGCCCTCACTCTTCCTCGGGAGCGCGCGAGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGCGCGGAGGAGCAGCTGGCGCGCGCGGGAGTCACGCTGTGCGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGCGCGGAGGAGCAGCTGGCGCGCGCGGGAGTCACGCTGTGCGTCAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTCCCGCCAGCAGCCCGGCCCGCGCGCGCCCGGCGTGGCAGAGCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCTCCCGCCAGCAGCCCGGCCCGCGCGCGCCCGGCGTGGCAGAGCTGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGCCCGTGTTCGACGACCCGGCTGAGGACCTGCTGGCGCACCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGCCCGTGTTCGACGACCCGGCTGAGGACCTGCTGGCGCACCTGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCACGTGCGCCGCCATGGAGGCCGCGGTGCGCGCCGGCGGCGCCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCACGTGCGCCGCCATGGAGGCCGCGGTGCGCGCCGGCGGCGCCTGCCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCTACTGCAAGAACGGCCGCAGCCGCTCGGCCGCCGTCTGCACCGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCTACTGCAAGAACGGCCGCAGCCGCTCGGCCGCCGTCTGCACCGCGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCATGCGGCACCGCGGCCTCAGCCTGGCGAAGGCCTTCCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100351 CCTCATGCGGCACCGCGGCCTCAGCCTGGCGAAGGCCTTCCAGGTG...C

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    394   ATGGTGAAGAGCGCTCGCCCGGTAGCAGAACCGAACCCGGGCTTCTGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100644 AGATGGTGAAGAGCGCTCGCCCGGTAGCAGAACCGAACCCGGGCTTCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCTCAGCTCCAGAAGTATGAGGAGGCCCTCCAGGCCCAGTCCTGCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100694 TCTCAGCTCCAGAAGTATGAGGAGGCCCTCCAGGCCCAGTCCTGCCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .
    492 GGGAGAGCCCCCAGCCTTAGGGTTGGGCCCTGAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100744 GGGAGAGCCCCCAGCCTTAGGGTTGGGCCCTGAGGCT