seq1 = pF1KE5073.tfa, 387 bp
seq2 = pF1KE5073/gi568815578r_44086326.tfa (gi568815578r:44086326_44286705), 200380 bp

>pF1KE5073 387
>gi568815578r:44086326_44286705 (Chr20)

(complement)

1-387  (100001-100384)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGGGGGCCGCTTCGACTTTGATGATGGAGGGGCGTACTGCGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGGGGGCCGCTTCGACTTTGATGATGGAGGGGCGTACTGCGGGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGGAGGGGGGAAAGGCCCATGGGCATGGACTGTGCACAGGCCCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGGAGGGGGGAAAGGCCCATGGGCATGGACTGTGCACAGGCCCCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCAGGGCGAATACTCTGGCTCCTGGAACTTTGGCTTTGAGGTGGCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCAGGGCGAATACTCTGGCTCCTGGAACTTTGGCTTTGAGGTGGCAGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCTATACCTGGCCCAGCGGAAACACCTTTGAGGGATACTGGAGCCAGGG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCTACACCTGGCCCAGCGGAAACACCTTTGAGGGATACTGGAGCCAGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAAACGGCATGGGCTGGGCATAGAGACCAAGGGGCGCTGGCTCTACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAACGGCATGGGCTGGGCATAGAGACCAAGGGGCGCTGGCTCTACAAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGAGTGGACACATGGCTTCAAGGGACGCTACGGAATCCGGCAGAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGAGTGGACACATGGCTTCAAGGGACGCTACGGAATCCGGCAGAGCTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCAGCGGTGCCAAGTATGAGGGCACCTGGAACAATGGCCTTCAAGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100301 AGCAGCGGTGCCAAGTATGAGGGCACCTGGAACAATGGCCTGCAAGACGG

    350     .    :    .    :    .    :    .
    351 CTATGGCACCGAGACCTATGCTGATGGAGGGATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||--|| |-
 100351 CTATGGCACCGAGACCTATGCTGATGGAGG  TGAG