seq1 = pF1KE5066.tfa, 2904 bp
seq2 = pF1KE5066/gi568815582r_70152724.tfa (gi568815582r:70152724_70382763), 230040 bp

>pF1KE5066 2904
>gi568815582r:70152724_70382763 (Chr16)

(complement)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-333  (105610-105798)   99% ->
334-479  (106133-106278)   100% ->
480-671  (110792-110983)   100% ->
672-816  (112424-112568)   100% ->
817-962  (113001-113146)   99% ->
963-1071  (114385-114493)   100% ->
1072-1222  (114955-115105)   100% ->
1223-1347  (117102-117226)   100% ->
1348-1492  (117662-117806)   100% ->
1493-1671  (120240-120418)   100% ->
1672-1785  (121607-121720)   100% ->
1786-1992  (123578-123784)   100% ->
1993-2177  (124547-124731)   100% ->
2178-2286  (126928-127036)   100% ->
2287-2400  (128030-128143)   100% ->
2401-2520  (128726-128845)   100% ->
2521-2607  (128964-129050)   100% ->
2608-2721  (129383-129496)   99% ->
2722-2904  (129858-130040)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTCTACTCTAACAGCAAGTGAAATCCGGCAGCGATTTATAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTCTACTCTAACAGCAAGTGAAATCCGGCAGCGATTTATAGATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCAAGAGGAACGAGCATACGTATGTTCACTCGTCTGCCACCATCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCAAGAGGAACGAGCATACGTATGTTCACTCGTCTGCCACCATCCCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGATGACCCCACTTTGCTCTTTGCCAATGCAGGCATGAACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 TGGATGACCCCACTTTGCTCTTTGCCAATGCAGGCATGAACCAGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    TTCAAACCCATTTTCCTGAACACAATTGACCCATCTCACCCCATGGC
        >>>|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105607 TAGTTTAAACCCATTTTCCTGAACACAATTGACCCATCTCACCCCATGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAGCTGAGCAGAGCTGCCAATACCCAGAAGTGCATCCGGGCTGGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105657 AAAGCTGAGCAGAGCTGCCAATACCCAGAAGTGCATCCGGGCTGGGGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AACATAATGACCTGGACGATGTGGGCAAGGATGTCTATCATCACACCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105707 AACATAATGACCTGGACGATGTGGGCAAGGATGTCTATCATCACACCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCGAGATGCTGGGCTCTTGGTCTTTTGGAGATTACTTTAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 105757 TTCGAGATGCTGGGCTCTTGGTCTTTTGGAGATTACTTTAAGGTA...TA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    334  GAATTGGCATGTAAGATGGCTCTGGAACTCCTCACCCAAGAGTTTGGCA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106132 GGAATTGGCATGTAAGATGGCTCTGGAACTCCTCACCCAAGAGTTTGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCCCATTGAAAGACTTTATGTTACTTACTTTGGCGGGGATGAAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106182 TTCCCATTGAAAGACTTTATGTTACTTACTTTGGCGGGGATGAAGCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCTTAGAAGCAGATCTGGAATGCAAACAGATCTGGCAAAATTTGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 106232 GGCTTAGAAGCAGATCTGGAATGCAAACAGATCTGGCAAAATTTGGGGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    480       GCTGGATGACACCAAAATCCTCCCAGGCAACATGAAGGATAACT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106282 ...CAGGCTGGATGACACCAAAATCCTCCCAGGCAACATGAAGGATAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTGGGAGATGGGTGACACGGGCCCCTGTGGTCCTTGCAGTGAGATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110836 TCTGGGAGATGGGTGACACGGGCCCCTGTGGTCCTTGCAGTGAGATCCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACGACCGGATTGGTGGTCGGGACGCCGCACATCTTGTCAACCAGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110886 TACGACCGGATTGGTGGTCGGGACGCCGCACATCTTGTCAACCAGGACGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CCCTAATGTGCTGGAGATCTGGAACCTTGTGTTCATCCAGTATAACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 110936 CCCTAATGTGCTGGAGATCTGGAACCTTGTGTTCATCCAGTATAACAGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    672        GGAAGCTGATGGCATTCTGAAACCTCTTCCCAAGAAAAGCATT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110986 A...CAGGGAAGCTGATGGCATTCTGAAACCTCTTCCCAAGAAAAGCATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GACACAGGGATGGGCCTGGAACGACTGGTATCTGTGCTGCAGAATAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112467 GACACAGGGATGGGCCTGGAACGACTGGTATCTGTGCTGCAGAATAAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GTCCAACTATGACACTGACCTTTTTGTCCCTTACTTTGAAGCCATTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112517 GTCCAACTATGACACTGACCTTTTTGTCCCTTACTTTGAAGCCATTCAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AG         GGCACAGGTGCCCGACCATACACTGGGAAAGTTGGTGCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112567 AGGTA...TAGGGCACAGGTGCCCGACCATACACTGGGAAAGTTGGTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAGGATGCCGATGGGATTGACATGGCCTACCGGGTGCTGGCTGACCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 113040 GAGGATGCCGATGGGATTGACATGGCCTACCGGGTGCTGGCTGACCACGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TCGGACCATCACTGTGGCACTGGCTGATGGTGGCCGGCCTGACAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113090 TCGGACCATCACTGTGGCACTGGCTGATGGTGGCCGGCCTGACAACACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GGCGTGG         ATATGTGTTGAGACGGATTCTCCGCCGAGCTGTC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113140 GGCGTGGGTA...CAGATATGTGTTGAGACGGATTCTCCGCCGAGCTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CGATACGCCCATGAAAAGCTCAATGCCAGCAGGGGCTTCTTTGCTACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114419 CGATACGCCCATGAAAAGCTCAATGCCAGCAGGGGCTTCTTTGCTACGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGTGGATGTTGTCGTCCAGTCCCTG         GGAGATGCATTTCCTG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 114469 AGTGGATGTTGTCGTCCAGTCCCTGGTA...CAGGGAGATGCATTTCCTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGCTGAAGAAGGACCCAGACATGGTGAAGGACATCATTAATGAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114971 AGCTGAAGAAGGACCCAGACATGGTGAAGGACATCATTAATGAAGAAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTGCAGTTTCTCAAGACTCTCAGCAGAGGGCGTCGCATCCTGGACAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115021 GTGCAGTTTCTCAAGACTCTCAGCAGAGGGCGTCGCATCCTGGACAGGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AATTCAGAGCCTGGGAGACAGCAAGACCATTCCCG         GAGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 115071 AATTCAGAGCCTGGGAGACAGCAAGACCATTCCCGGTA...TAGGAGACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTGCTTGGCTCCTCTATGACACCTATGGGTTTCCAGTGGATCTGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117108 CTGCTTGGCTCCTCTATGACACCTATGGGTTTCCAGTGGATCTGACTGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CTGATTGCTGAAGAGAAGGGCCTGGTGGTAGACATGGATGGCTTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117158 CTGATTGCTGAAGAGAAGGGCCTGGTGGTAGACATGGATGGCTTTGAAGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GGAGAGGAAACTGGCCCAG         CTGAAATCACAGGGCAAGGGAG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 117208 GGAGAGGAAACTGGCCCAGGTA...CAGCTGAAATCACAGGGCAAGGGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTGGTGGGGAAGACCTCATTATGCTGGACATTTACGCTATCGAAGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117684 CTGGTGGGGAAGACCTCATTATGCTGGACATTTACGCTATCGAAGAGCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CGGGCACGGGGTCTGGAGGTCACAGATGATTCCCCAAAGTACAATTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117734 CGGGCACGGGGTCTGGAGGTCACAGATGATTCCCCAAAGTACAATTACCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TTTGGACTCCAGTGGTAGCTATG         TATTTGAGAACACAGTGG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 117784 TTTGGACTCCAGTGGTAGCTATGGTA...CAGTATTTGAGAACACAGTGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 CTACGGTGATGGCTCTGCGCAGGGAGAAGATGTTCGTGGAAGAGGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120258 CTACGGTGATGGCTCTGCGCAGGGAGAAGATGTTCGTGGAAGAGGTGTCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 ACAGGCCAGGAGTGTGGAGTGGTGCTGGACAAGACCTGTTTCTATGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120308 ACAGGCCAGGAGTGTGGAGTGGTGCTGGACAAGACCTGTTTCTATGCTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GCAAGGAGGCCAGATCTATGACGAAGGCTACCTGGTGAAGGTGGATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120358 GCAAGGAGGCCAGATCTATGACGAAGGCTACCTGGTGAAGGTGGATGACA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GCAGTGAAGAT         AAAACAGAGTTTACAGTGAAGAATGCTCAG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 120408 GCAGTGAAGATGTG...TAGAAAACAGAGTTTACAGTGAAGAATGCTCAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GTCCGAGGAGGGTATGTGCTACACATTGGAACCATCTACGGTGACCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121637 GTCCGAGGAGGGTATGTGCTACACATTGGAACCATCTACGGTGACCTGAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AGTGGGGGATCAGGTCTGGCTGTTTATTGATGAG         CCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 121687 AGTGGGGGATCAGGTCTGGCTGTTTATTGATGAGGTG...CAGCCCCGAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 GAAGACCCATCATGAGCAACCACACAGCTACGCACATTCTGAACTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123585 GAAGACCCATCATGAGCAACCACACAGCTACGCACATTCTGAACTTCGCC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 CTGCGCTCAGTGCTTGGGGAAGCTGACCAGAAAGGCTCATTGGTTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123635 CTGCGCTCAGTGCTTGGGGAAGCTGACCAGAAAGGCTCATTGGTTGCTCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TGACCGCCTCAGATTTGACTTTACTGCCAAGGGAGCCATGTCCACCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123685 TGACCGCCTCAGATTTGACTTTACTGCCAAGGGAGCCATGTCCACCCAAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 AGATCAAGAAGGCTGAAGAGATTGCTAATGAGATGATTGAGGCAGCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123735 AGATCAAGAAGGCTGAAGAGATTGCTAATGAGATGATTGAGGCAGCCAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993          GCCGTCTATACCCAGGATTGCCCCCTGGCAGCAGCGAAAGC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123785 GTA...CAGGCCGTCTATACCCAGGATTGCCCCCTGGCAGCAGCGAAAGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 CATCCAGGGCCTACGGGCTGTGTTTGATGAGACCTATCCTGACCCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124588 CATCCAGGGCCTACGGGCTGTGTTTGATGAGACCTATCCTGACCCTGTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 GAGTCGTCTCCATTGGGGTCCCGGTGTCCGAGTTGCTGGATGACCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124638 GAGTCGTCTCCATTGGGGTCCCGGTGTCCGAGTTGCTGGATGACCCCTCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 GGGCCTGCTGGCTCCCTGACTTCTGTTGAGTTCTGTGGGGGAAC      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 124688 GGGCCTGCTGGCTCCCTGACTTCTGTTGAGTTCTGTGGGGGAACGTG...

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2178    GCACCTGCGGAACTCGAGTCATGCAGGAGCTTTTGTGATCGTGACGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126925 CAGGCACCTGCGGAACTCGAGTCATGCAGGAGCTTTTGTGATCGTGACGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 AAGAAGCCATTGCCAAGGGTATCCGGAGGATTGTGGCTGTCACAGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126975 AAGAAGCCATTGCCAAGGGTATCCGGAGGATTGTGGCTGTCACAGGTGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 GAGGCCCAGAAG         GCCCTCAGGAAAGCAGAGAGCTTGAAGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 127025 GAGGCCCAGAAGGTG...CAGGCCCTCAGGAAAGCAGAGAGCTTGAAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 ATGTCTCTCTGTCATGGAAGCCAAAGTGAAGGCTCAGACTGCTCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128059 ATGTCTCTCTGTCATGGAAGCCAAAGTGAAGGCTCAGACTGCTCCAAACA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 AGGATGTGCAGAGGGAGATCGCTGACCTTGGAGAG         GCCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 128109 AGGATGTGCAGAGGGAGATCGCTGACCTTGGAGAGGTA...CAGGCCCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 GCCACTGCAGTCATCCCCCAGTGGCAGAAGGATGAATTGCGGGAGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128732 GCCACTGCAGTCATCCCCCAGTGGCAGAAGGATGAATTGCGGGAGACTCT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CAAATCCCTAAAGAAGGTCATGGATGACTTGGACCGAGCCAGCAAAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128782 CAAATCCCTAAAGAAGGTCATGGATGACTTGGACCGAGCCAGCAAAGCCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 ATGTCCAGAAACGA         GTGTTAGAGAAGACGAAGCAGTTCATC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 128832 ATGTCCAGAAACGAGTG...CAGGTGTTAGAGAAGACGAAGCAGTTCATC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 GACAGCAACCCCAACCAGCCTCTTGTCATCCTGGAGATGGAGAGCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128991 GACAGCAACCCCAACCAGCCTCTTGTCATCCTGGAGATGGAGAGCGGCGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 CTCAGCCAAG         GCCCTGAATGAAGCCTTGAAGCTCTTCAAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 129041 CTCAGCCAAGGCA...CAGGCCCTGAATGAAGCCTTGAAGCTCTTCAAGA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TGCACTCCCCTCAGACTTCTGCCATGCTCTTCACGGTGGACAATGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129414 TGCACTCCCCTCAGACTTCTGCCATGCTCTTCACGGTGGACAATGAGGCT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GGCAAGATCACGTGCCTGTGTCAAGTCCCCCAG         AATGCAGC
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||>>>...>>>||||||||
 129464 GGCAAGATCACGTGCCTGTGTCAAGTTCCCCAGGTC...TAGAATGCAGC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 CAATCGGGGCTTAAAAGCCAGCGAGTGGGTGCAGCAGGTGTCAGGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129866 CAATCGGGGCTTAAAAGCCAGCGAGTGGGTGCAGCAGGTGTCAGGCTTGA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 TGGACGGTAAAGGTGGTGGCAAGGATGTGTCTGCACAGGCCACAGGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129916 TGGACGGTAAAGGTGGTGGCAAGGATGTGTCTGCACAGGCCACAGGCAAG

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 AACGTTGGCTGCCTGCAGGAGGCGCTGCAGCTGGCCACTTCCTTCGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129966 AACGTTGGCTGCCTGCAGGAGGCGCTGCAGCTGGCCACTTCCTTCGCCCA

   3050     .    :    .    :    .
   2880 GCTGCGCCTCGGGGATGTAAAGAAC
        |||||||||||||||||||||||||
 130016 GCTGCGCCTCGGGGATGTAAAGAAC